Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ5

Tcf19, Transcription factor 19-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf19Q99KJ5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcf19Q99KJ5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcf19Q99KJ5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcf19Q99KJ5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcf19Q99KJ5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcf19Q99KJ5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcf19Q99KJ5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcf19Q99KJ5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcf19Q99KJ5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcf19Q99KJ5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcf19Q99KJ5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcf19Q99KJ5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcf19Q99KJ5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcf19Q99KJ5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcf19Q99KJ5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcf19Q99KJ5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcf19Q99KJ5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcf19Q99KJ5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcf19Q99KJ5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcf19Q99KJ5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcf19Q99KJ5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcf19Q99KJ5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcf19Q99KJ5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcf19Q99KJ5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcf19Q99KJ5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcf19Q99KJ5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcf19Q99KJ5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcf19Q99KJ5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tcf19Q99KJ5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tcf19Q99KJ5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tcf19Q99KJ5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcf19Q99KJ5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcf19Q99KJ5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcf19Q99KJ5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcf19Q99KJ5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcf19Q99KJ5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcf19Q99KJ5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcf19Q99KJ5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcf19Q99KJ5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcf19Q99KJ5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcf19Q99KJ5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcf19Q99KJ5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcf19Q99KJ5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcf19Q99KJ5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcf19Q99KJ5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcf19Q99KJ5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcf19Q99KJ5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcf19Q99KJ5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcf19Q99KJ5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcf19Q99KJ5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcf19Q99KJ5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcf19Q99KJ5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcf19Q99KJ5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcf19Q99KJ5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcf19Q99KJ5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcf19Q99KJ5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcf19Q99KJ5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcf19Q99KJ5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcf19Q99KJ5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcf19Q99KJ5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcf19Q99KJ5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcf19Q99KJ5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcf19Q99KJ5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tcf19Q99KJ5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tcf19Q99KJ5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tcf19Q99KJ5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tcf19Q99KJ5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tcf19Q99KJ5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tcf19Q99KJ5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Tcf19Q99KJ5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcf19Q99KJ5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcf19Q99KJ5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcf19Q99KJ5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcf19Q99KJ5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcf19Q99KJ5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcf19Q99KJ5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcf19Q99KJ5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcf19Q99KJ5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcf19Q99KJ5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcf19Q99KJ5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcf19Q99KJ5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcf19Q99KJ5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcf19Q99KJ5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcf19Q99KJ5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcf19Q99KJ5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcf19Q99KJ5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcf19Q99KJ5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcf19Q99KJ5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcf19Q99KJ5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcf19Q99KJ5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcf19Q99KJ5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tcf19Q99KJ5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tcf19Q99KJ5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tcf19Q99KJ5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tcf19Q99KJ5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tcf19Q99KJ5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tcf19Q99KJ5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tcf19Q99KJ5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tcf19Q99KJ5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tcf19Q99KJ5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms