Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ubxn2aQ99KJ0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ubxn2aQ99KJ0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ubxn2aQ99KJ0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ubxn2aQ99KJ0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ubxn2aQ99KJ0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ubxn2aQ99KJ0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ubxn2aQ99KJ0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ubxn2aQ99KJ0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ubxn2aQ99KJ0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ubxn2aQ99KJ0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ubxn2aQ99KJ0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ubxn2aQ99KJ0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ubxn2aQ99KJ0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ubxn2aQ99KJ0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ubxn2aQ99KJ0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ubxn2aQ99KJ0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ubxn2aQ99KJ0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ubxn2aQ99KJ0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ubxn2aQ99KJ0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ubxn2aQ99KJ0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ubxn2aQ99KJ0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ubxn2aQ99KJ0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ubxn2aQ99KJ0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ubxn2aQ99KJ0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ubxn2aQ99KJ0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ubxn2aQ99KJ0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubxn2aQ99KJ0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubxn2aQ99KJ0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubxn2aQ99KJ0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubxn2aQ99KJ0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubxn2aQ99KJ0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubxn2aQ99KJ0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ubxn2aQ99KJ0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ubxn2aQ99KJ0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ubxn2aQ99KJ0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ubxn2aQ99KJ0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ubxn2aQ99KJ0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ubxn2aQ99KJ0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ubxn2aQ99KJ0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ubxn2aQ99KJ0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ubxn2aQ99KJ0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubxn2aQ99KJ0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubxn2aQ99KJ0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubxn2aQ99KJ0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubxn2aQ99KJ0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ubxn2aQ99KJ0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubxn2aQ99KJ0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubxn2aQ99KJ0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubxn2aQ99KJ0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ubxn2aQ99KJ0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ubxn2aQ99KJ0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ubxn2aQ99KJ0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubxn2aQ99KJ0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubxn2aQ99KJ0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubxn2aQ99KJ0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubxn2aQ99KJ0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubxn2aQ99KJ0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubxn2aQ99KJ0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ubxn2aQ99KJ0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ubxn2aQ99KJ0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ubxn2aQ99KJ0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ubxn2aQ99KJ0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ubxn2aQ99KJ0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ubxn2aQ99KJ0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ubxn2aQ99KJ0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ubxn2aQ99KJ0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ubxn2aQ99KJ0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ubxn2aQ99KJ0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ubxn2aQ99KJ0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ubxn2aQ99KJ0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ubxn2aQ99KJ0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ubxn2aQ99KJ0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ubxn2aQ99KJ0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ubxn2aQ99KJ0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ubxn2aQ99KJ0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ubxn2aQ99KJ0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ubxn2aQ99KJ0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ubxn2aQ99KJ0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ubxn2aQ99KJ0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ubxn2aQ99KJ0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ubxn2aQ99KJ0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ubxn2aQ99KJ0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ubxn2aQ99KJ0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ubxn2aQ99KJ0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms