Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH8

Kdelr1, ER lumen protein-retaining receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr1Q99JH8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdelr1Q99JH8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdelr1Q99JH8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdelr1Q99JH8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdelr1Q99JH8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdelr1Q99JH8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdelr1Q99JH8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdelr1Q99JH8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdelr1Q99JH8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdelr1Q99JH8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdelr1Q99JH8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdelr1Q99JH8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdelr1Q99JH8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdelr1Q99JH8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdelr1Q99JH8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdelr1Q99JH8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdelr1Q99JH8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdelr1Q99JH8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdelr1Q99JH8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdelr1Q99JH8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdelr1Q99JH8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdelr1Q99JH8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdelr1Q99JH8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdelr1Q99JH8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdelr1Q99JH8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdelr1Q99JH8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdelr1Q99JH8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdelr1Q99JH8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdelr1Q99JH8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdelr1Q99JH8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdelr1Q99JH8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdelr1Q99JH8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdelr1Q99JH8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdelr1Q99JH8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdelr1Q99JH8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdelr1Q99JH8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdelr1Q99JH8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdelr1Q99JH8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kdelr1Q99JH8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdelr1Q99JH8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdelr1Q99JH8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdelr1Q99JH8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdelr1Q99JH8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdelr1Q99JH8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdelr1Q99JH8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdelr1Q99JH8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdelr1Q99JH8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdelr1Q99JH8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdelr1Q99JH8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdelr1Q99JH8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdelr1Q99JH8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdelr1Q99JH8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdelr1Q99JH8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdelr1Q99JH8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdelr1Q99JH8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdelr1Q99JH8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdelr1Q99JH8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdelr1Q99JH8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdelr1Q99JH8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdelr1Q99JH8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdelr1Q99JH8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdelr1Q99JH8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdelr1Q99JH8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdelr1Q99JH8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdelr1Q99JH8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdelr1Q99JH8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdelr1Q99JH8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdelr1Q99JH8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdelr1Q99JH8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdelr1Q99JH8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdelr1Q99JH8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kdelr1Q99JH8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kdelr1Q99JH8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdelr1Q99JH8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdelr1Q99JH8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdelr1Q99JH8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdelr1Q99JH8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdelr1Q99JH8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdelr1Q99JH8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdelr1Q99JH8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdelr1Q99JH8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdelr1Q99JH8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdelr1Q99JH8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdelr1Q99JH8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdelr1Q99JH8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdelr1Q99JH8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdelr1Q99JH8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdelr1Q99JH8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdelr1Q99JH8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdelr1Q99JH8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdelr1Q99JH8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdelr1Q99JH8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdelr1Q99JH8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdelr1Q99JH8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdelr1Q99JH8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdelr1Q99JH8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdelr1Q99JH8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdelr1Q99JH8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdelr1Q99JH8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdelr1Q99JH8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms