Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddb2Q99J79 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddb2Q99J79 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddb2Q99J79 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddb2Q99J79 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddb2Q99J79 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddb2Q99J79 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddb2Q99J79 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddb2Q99J79 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddb2Q99J79 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddb2Q99J79 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddb2Q99J79 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddb2Q99J79 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddb2Q99J79 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddb2Q99J79 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddb2Q99J79 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddb2Q99J79 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ddb2Q99J79 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ddb2Q99J79 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ddb2Q99J79 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ddb2Q99J79 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ddb2Q99J79 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ddb2Q99J79 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddb2Q99J79 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddb2Q99J79 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddb2Q99J79 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddb2Q99J79 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddb2Q99J79 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddb2Q99J79 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddb2Q99J79 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddb2Q99J79 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddb2Q99J79 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddb2Q99J79 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddb2Q99J79 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddb2Q99J79 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddb2Q99J79 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddb2Q99J79 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddb2Q99J79 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddb2Q99J79 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddb2Q99J79 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddb2Q99J79 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddb2Q99J79 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddb2Q99J79 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddb2Q99J79 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddb2Q99J79 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddb2Q99J79 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddb2Q99J79 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddb2Q99J79 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddb2Q99J79 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddb2Q99J79 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddb2Q99J79 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddb2Q99J79 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddb2Q99J79 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddb2Q99J79 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddb2Q99J79 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddb2Q99J79 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddb2Q99J79 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddb2Q99J79 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddb2Q99J79 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddb2Q99J79 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddb2Q99J79 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms