Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csmd1Q923L3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csmd1Q923L3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csmd1Q923L3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csmd1Q923L3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csmd1Q923L3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csmd1Q923L3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csmd1Q923L3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csmd1Q923L3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Csmd1Q923L3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csmd1Q923L3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csmd1Q923L3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csmd1Q923L3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csmd1Q923L3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csmd1Q923L3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csmd1Q923L3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Csmd1Q923L3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csmd1Q923L3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csmd1Q923L3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csmd1Q923L3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csmd1Q923L3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csmd1Q923L3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Csmd1Q923L3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csmd1Q923L3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csmd1Q923L3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csmd1Q923L3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csmd1Q923L3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csmd1Q923L3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csmd1Q923L3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Csmd1Q923L3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Csmd1Q923L3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Csmd1Q923L3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Csmd1Q923L3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Csmd1Q923L3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Csmd1Q923L3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Csmd1Q923L3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csmd1Q923L3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csmd1Q923L3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csmd1Q923L3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csmd1Q923L3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csmd1Q923L3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csmd1Q923L3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csmd1Q923L3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csmd1Q923L3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Csmd1Q923L3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csmd1Q923L3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csmd1Q923L3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Csmd1Q923L3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csmd1Q923L3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csmd1Q923L3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csmd1Q923L3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Csmd1Q923L3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csmd1Q923L3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csmd1Q923L3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csmd1Q923L3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csmd1Q923L3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csmd1Q923L3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csmd1Q923L3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csmd1Q923L3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csmd1Q923L3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csmd1Q923L3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csmd1Q923L3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csmd1Q923L3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csmd1Q923L3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csmd1Q923L3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Csmd1Q923L3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csmd1Q923L3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csmd1Q923L3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csmd1Q923L3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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