Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smc1bQ920F6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smc1bQ920F6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smc1bQ920F6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smc1bQ920F6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smc1bQ920F6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smc1bQ920F6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smc1bQ920F6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Smc1bQ920F6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smc1bQ920F6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smc1bQ920F6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smc1bQ920F6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smc1bQ920F6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smc1bQ920F6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smc1bQ920F6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smc1bQ920F6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smc1bQ920F6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smc1bQ920F6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smc1bQ920F6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smc1bQ920F6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smc1bQ920F6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smc1bQ920F6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smc1bQ920F6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smc1bQ920F6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smc1bQ920F6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smc1bQ920F6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smc1bQ920F6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Smc1bQ920F6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smc1bQ920F6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smc1bQ920F6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Smc1bQ920F6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smc1bQ920F6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smc1bQ920F6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smc1bQ920F6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smc1bQ920F6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smc1bQ920F6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smc1bQ920F6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smc1bQ920F6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smc1bQ920F6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smc1bQ920F6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smc1bQ920F6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smc1bQ920F6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smc1bQ920F6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smc1bQ920F6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smc1bQ920F6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smc1bQ920F6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smc1bQ920F6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smc1bQ920F6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smc1bQ920F6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smc1bQ920F6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Smc1bQ920F6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smc1bQ920F6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smc1bQ920F6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smc1bQ920F6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smc1bQ920F6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smc1bQ920F6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smc1bQ920F6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smc1bQ920F6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smc1bQ920F6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smc1bQ920F6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smc1bQ920F6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smc1bQ920F6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smc1bQ920F6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smc1bQ920F6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smc1bQ920F6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smc1bQ920F6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smc1bQ920F6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smc1bQ920F6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smc1bQ920F6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smc1bQ920F6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Smc1bQ920F6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smc1bQ920F6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smc1bQ920F6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Smc1bQ920F6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smc1bQ920F6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smc1bQ920F6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smc1bQ920F6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Smc1bQ920F6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Smc1bQ920F6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smc1bQ920F6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smc1bQ920F6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smc1bQ920F6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smc1bQ920F6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smc1bQ920F6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smc1bQ920F6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smc1bQ920F6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smc1bQ920F6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Smc1bQ920F6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smc1bQ920F6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smc1bQ920F6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smc1bQ920F6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smc1bQ920F6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smc1bQ920F6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smc1bQ920F6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smc1bQ920F6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smc1bQ920F6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Smc1bQ920F6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Smc1bQ920F6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Smc1bQ920F6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smc1bQ920F6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms