Protein–RNA interactions for Protein: Q91X93

Prb1, Proline-rich protein BstNI subfamily 1, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prb1Q91X93 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prb1Q91X93 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prb1Q91X93 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prb1Q91X93 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prb1Q91X93 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prb1Q91X93 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prb1Q91X93 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prb1Q91X93 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Prb1Q91X93 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prb1Q91X93 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prb1Q91X93 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prb1Q91X93 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prb1Q91X93 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prb1Q91X93 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prb1Q91X93 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prb1Q91X93 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prb1Q91X93 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prb1Q91X93 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prb1Q91X93 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Prb1Q91X93 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prb1Q91X93 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prb1Q91X93 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prb1Q91X93 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prb1Q91X93 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prb1Q91X93 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Prb1Q91X93 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Prb1Q91X93 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prb1Q91X93 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prb1Q91X93 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prb1Q91X93 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prb1Q91X93 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prb1Q91X93 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prb1Q91X93 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prb1Q91X93 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prb1Q91X93 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prb1Q91X93 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prb1Q91X93 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prb1Q91X93 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prb1Q91X93 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prb1Q91X93 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prb1Q91X93 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prb1Q91X93 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prb1Q91X93 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prb1Q91X93 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prb1Q91X93 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prb1Q91X93 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prb1Q91X93 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Prb1Q91X93 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prb1Q91X93 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prb1Q91X93 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Prb1Q91X93 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prb1Q91X93 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prb1Q91X93 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prb1Q91X93 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prb1Q91X93 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prb1Q91X93 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prb1Q91X93 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prb1Q91X93 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prb1Q91X93 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms