Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Csde1Q91W50 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Csde1Q91W50 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Csde1Q91W50 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Csde1Q91W50 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Csde1Q91W50 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Csde1Q91W50 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Csde1Q91W50 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Csde1Q91W50 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Csde1Q91W50 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Csde1Q91W50 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Csde1Q91W50 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Csde1Q91W50 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Csde1Q91W50 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Csde1Q91W50 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Csde1Q91W50 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Csde1Q91W50 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Csde1Q91W50 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Csde1Q91W50 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Csde1Q91W50 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Csde1Q91W50 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Csde1Q91W50 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Csde1Q91W50 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Csde1Q91W50 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Csde1Q91W50 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Csde1Q91W50 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Csde1Q91W50 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Csde1Q91W50 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Csde1Q91W50 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Csde1Q91W50 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Csde1Q91W50 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Csde1Q91W50 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Csde1Q91W50 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Csde1Q91W50 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Csde1Q91W50 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Csde1Q91W50 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Csde1Q91W50 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Csde1Q91W50 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Csde1Q91W50 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Csde1Q91W50 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Csde1Q91W50 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Csde1Q91W50 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Csde1Q91W50 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Csde1Q91W50 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Csde1Q91W50 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Csde1Q91W50 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Csde1Q91W50 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Csde1Q91W50 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Csde1Q91W50 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Csde1Q91W50 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Csde1Q91W50 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Csde1Q91W50 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Csde1Q91W50 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Csde1Q91W50 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Csde1Q91W50 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Csde1Q91W50 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Csde1Q91W50 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Csde1Q91W50 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Csde1Q91W50 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Csde1Q91W50 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Csde1Q91W50 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Csde1Q91W50 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Csde1Q91W50 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Csde1Q91W50 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Csde1Q91W50 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Csde1Q91W50 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Csde1Q91W50 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Csde1Q91W50 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csde1Q91W50 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms