Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx18Q8VDS8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx18Q8VDS8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx18Q8VDS8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx18Q8VDS8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx18Q8VDS8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx18Q8VDS8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx18Q8VDS8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx18Q8VDS8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx18Q8VDS8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx18Q8VDS8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx18Q8VDS8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx18Q8VDS8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx18Q8VDS8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx18Q8VDS8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx18Q8VDS8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx18Q8VDS8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx18Q8VDS8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx18Q8VDS8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx18Q8VDS8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx18Q8VDS8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx18Q8VDS8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx18Q8VDS8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx18Q8VDS8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx18Q8VDS8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx18Q8VDS8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx18Q8VDS8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx18Q8VDS8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx18Q8VDS8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx18Q8VDS8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx18Q8VDS8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx18Q8VDS8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx18Q8VDS8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx18Q8VDS8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx18Q8VDS8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx18Q8VDS8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx18Q8VDS8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx18Q8VDS8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx18Q8VDS8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx18Q8VDS8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx18Q8VDS8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx18Q8VDS8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx18Q8VDS8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx18Q8VDS8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx18Q8VDS8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx18Q8VDS8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx18Q8VDS8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx18Q8VDS8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx18Q8VDS8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx18Q8VDS8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx18Q8VDS8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx18Q8VDS8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx18Q8VDS8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx18Q8VDS8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx18Q8VDS8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx18Q8VDS8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx18Q8VDS8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx18Q8VDS8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx18Q8VDS8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms