Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rprd1aQ8VDS4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rprd1aQ8VDS4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rprd1aQ8VDS4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rprd1aQ8VDS4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rprd1aQ8VDS4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rprd1aQ8VDS4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rprd1aQ8VDS4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rprd1aQ8VDS4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rprd1aQ8VDS4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rprd1aQ8VDS4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rprd1aQ8VDS4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rprd1aQ8VDS4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rprd1aQ8VDS4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rprd1aQ8VDS4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rprd1aQ8VDS4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rprd1aQ8VDS4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rprd1aQ8VDS4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rprd1aQ8VDS4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rprd1aQ8VDS4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rprd1aQ8VDS4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rprd1aQ8VDS4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rprd1aQ8VDS4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rprd1aQ8VDS4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rprd1aQ8VDS4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rprd1aQ8VDS4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rprd1aQ8VDS4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rprd1aQ8VDS4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rprd1aQ8VDS4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rprd1aQ8VDS4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rprd1aQ8VDS4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rprd1aQ8VDS4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rprd1aQ8VDS4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rprd1aQ8VDS4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rprd1aQ8VDS4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rprd1aQ8VDS4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rprd1aQ8VDS4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rprd1aQ8VDS4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rprd1aQ8VDS4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rprd1aQ8VDS4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rprd1aQ8VDS4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rprd1aQ8VDS4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rprd1aQ8VDS4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rprd1aQ8VDS4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rprd1aQ8VDS4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rprd1aQ8VDS4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rprd1aQ8VDS4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rprd1aQ8VDS4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rprd1aQ8VDS4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rprd1aQ8VDS4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rprd1aQ8VDS4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rprd1aQ8VDS4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rprd1aQ8VDS4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rprd1aQ8VDS4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rprd1aQ8VDS4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rprd1aQ8VDS4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rprd1aQ8VDS4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rprd1aQ8VDS4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rprd1aQ8VDS4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rprd1aQ8VDS4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rprd1aQ8VDS4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rprd1aQ8VDS4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rprd1aQ8VDS4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rprd1aQ8VDS4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rprd1aQ8VDS4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rprd1aQ8VDS4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rprd1aQ8VDS4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rprd1aQ8VDS4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rprd1aQ8VDS4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rprd1aQ8VDS4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rprd1aQ8VDS4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rprd1aQ8VDS4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rprd1aQ8VDS4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rprd1aQ8VDS4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rprd1aQ8VDS4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rprd1aQ8VDS4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rprd1aQ8VDS4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rprd1aQ8VDS4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rprd1aQ8VDS4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rprd1aQ8VDS4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rprd1aQ8VDS4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rprd1aQ8VDS4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rprd1aQ8VDS4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms