Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2I7

Defb11, Beta-defensin 11, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb11Q8R2I7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,3■□□□□ 0,2
Defb11Q8R2I7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,3■□□□□ 0,2
Defb11Q8R2I7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,3■□□□□ 0,2
Defb11Q8R2I7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16,29■□□□□ 0,2
Defb11Q8R2I7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,29■□□□□ 0,2
Defb11Q8R2I7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,29■□□□□ 0,2
Defb11Q8R2I7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,29■□□□□ 0,2
Defb11Q8R2I7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16,28■□□□□ 0,2
Defb11Q8R2I7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16,28■□□□□ 0,2
Defb11Q8R2I7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16,28■□□□□ 0,2
Defb11Q8R2I7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16,28■□□□□ 0,2
Defb11Q8R2I7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,28■□□□□ 0,2
Defb11Q8R2I7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,28■□□□□ 0,2
Defb11Q8R2I7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,28■□□□□ 0,2
Defb11Q8R2I7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,27■□□□□ 0,2
Defb11Q8R2I7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16,27■□□□□ 0,2
Defb11Q8R2I7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16,27■□□□□ 0,2
Defb11Q8R2I7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,26■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,26■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16,26■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,26■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16,26■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,26■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,26■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16,26■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16,26■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16,25■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,25■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,25■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16,25■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,25■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,25■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16,25■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,25■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16,25■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,25■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,24■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,24■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16,24■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16,24■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16,24■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16,23■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16,23■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,23■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16,23■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16,23■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,23■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,23■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,23■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,23■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,23■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16,22■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,22■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16,22■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16,22■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,22■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,22■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,22■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,21■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,21■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,21■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16,21■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16,21■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16,21■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,21■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16,21■□□□□ 0,19
Defb11Q8R2I7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16,21■□□□□ 0,18
Defb11Q8R2I7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,2■□□□□ 0,18
Defb11Q8R2I7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,2■□□□□ 0,18
Defb11Q8R2I7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16,2■□□□□ 0,18
Defb11Q8R2I7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16,2■□□□□ 0,18
Defb11Q8R2I7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16,2■□□□□ 0,18
Defb11Q8R2I7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,2■□□□□ 0,18
Defb11Q8R2I7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16,2■□□□□ 0,18
Defb11Q8R2I7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,19■□□□□ 0,18
Defb11Q8R2I7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,19■□□□□ 0,18
Defb11Q8R2I7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,19■□□□□ 0,18
Defb11Q8R2I7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,19■□□□□ 0,18
Defb11Q8R2I7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
Defb11Q8R2I7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
Defb11Q8R2I7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16,18■□□□□ 0,18
Defb11Q8R2I7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16,18■□□□□ 0,18
Defb11Q8R2I7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16,18■□□□□ 0,18
Defb11Q8R2I7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16,18■□□□□ 0,18
Defb11Q8R2I7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
Defb11Q8R2I7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16,18■□□□□ 0,18
Defb11Q8R2I7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16,18■□□□□ 0,18
Defb11Q8R2I7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16,17■□□□□ 0,18
Defb11Q8R2I7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16,17■□□□□ 0,18
Defb11Q8R2I7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,17■□□□□ 0,18
Defb11Q8R2I7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,17■□□□□ 0,18
Defb11Q8R2I7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,17■□□□□ 0,18
Defb11Q8R2I7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16,17■□□□□ 0,18
Defb11Q8R2I7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16,16■□□□□ 0,18
Defb11Q8R2I7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,16■□□□□ 0,18
Defb11Q8R2I7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16,16■□□□□ 0,18
Defb11Q8R2I7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16,16■□□□□ 0,18
Defb11Q8R2I7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,16■□□□□ 0,18
Defb11Q8R2I7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,16■□□□□ 0,18
Defb11Q8R2I7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,15■□□□□ 0,18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms