Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1Q0

Stx19, Syntaxin-19, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx19Q8R1Q0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx19Q8R1Q0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx19Q8R1Q0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx19Q8R1Q0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx19Q8R1Q0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx19Q8R1Q0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx19Q8R1Q0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx19Q8R1Q0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx19Q8R1Q0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx19Q8R1Q0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx19Q8R1Q0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx19Q8R1Q0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx19Q8R1Q0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx19Q8R1Q0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx19Q8R1Q0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx19Q8R1Q0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx19Q8R1Q0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx19Q8R1Q0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx19Q8R1Q0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx19Q8R1Q0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx19Q8R1Q0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx19Q8R1Q0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx19Q8R1Q0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx19Q8R1Q0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx19Q8R1Q0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx19Q8R1Q0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx19Q8R1Q0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx19Q8R1Q0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx19Q8R1Q0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx19Q8R1Q0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx19Q8R1Q0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stx19Q8R1Q0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stx19Q8R1Q0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stx19Q8R1Q0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx19Q8R1Q0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx19Q8R1Q0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx19Q8R1Q0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx19Q8R1Q0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx19Q8R1Q0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx19Q8R1Q0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx19Q8R1Q0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx19Q8R1Q0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx19Q8R1Q0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx19Q8R1Q0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx19Q8R1Q0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx19Q8R1Q0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx19Q8R1Q0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx19Q8R1Q0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx19Q8R1Q0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx19Q8R1Q0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx19Q8R1Q0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx19Q8R1Q0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx19Q8R1Q0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx19Q8R1Q0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx19Q8R1Q0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx19Q8R1Q0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx19Q8R1Q0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx19Q8R1Q0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx19Q8R1Q0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124 ms