Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mtmr3Q8K296 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mtmr3Q8K296 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mtmr3Q8K296 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mtmr3Q8K296 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mtmr3Q8K296 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mtmr3Q8K296 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mtmr3Q8K296 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mtmr3Q8K296 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mtmr3Q8K296 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mtmr3Q8K296 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Mtmr3Q8K296 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mtmr3Q8K296 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Mtmr3Q8K296 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Mtmr3Q8K296 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mtmr3Q8K296 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mtmr3Q8K296 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mtmr3Q8K296 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mtmr3Q8K296 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mtmr3Q8K296 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mtmr3Q8K296 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mtmr3Q8K296 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Mtmr3Q8K296 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mtmr3Q8K296 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mtmr3Q8K296 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mtmr3Q8K296 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mtmr3Q8K296 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mtmr3Q8K296 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Mtmr3Q8K296 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Mtmr3Q8K296 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mtmr3Q8K296 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mtmr3Q8K296 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mtmr3Q8K296 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Mtmr3Q8K296 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mtmr3Q8K296 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mtmr3Q8K296 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mtmr3Q8K296 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mtmr3Q8K296 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mtmr3Q8K296 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mtmr3Q8K296 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mtmr3Q8K296 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mtmr3Q8K296 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mtmr3Q8K296 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mtmr3Q8K296 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mtmr3Q8K296 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mtmr3Q8K296 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mtmr3Q8K296 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mtmr3Q8K296 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mtmr3Q8K296 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mtmr3Q8K296 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mtmr3Q8K296 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mtmr3Q8K296 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mtmr3Q8K296 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mtmr3Q8K296 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mtmr3Q8K296 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mtmr3Q8K296 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mtmr3Q8K296 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mtmr3Q8K296 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mtmr3Q8K296 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mtmr3Q8K296 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mtmr3Q8K296 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mtmr3Q8K296 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mtmr3Q8K296 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mtmr3Q8K296 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mtmr3Q8K296 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mtmr3Q8K296 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mtmr3Q8K296 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mtmr3Q8K296 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mtmr3Q8K296 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Mtmr3Q8K296 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mtmr3Q8K296 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mtmr3Q8K296 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mtmr3Q8K296 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Mtmr3Q8K296 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mtmr3Q8K296 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mtmr3Q8K296 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Mtmr3Q8K296 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mtmr3Q8K296 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mtmr3Q8K296 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mtmr3Q8K296 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Mtmr3Q8K296 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Mtmr3Q8K296 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Mtmr3Q8K296 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mtmr3Q8K296 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mtmr3Q8K296 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mtmr3Q8K296 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mtmr3Q8K296 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mtmr3Q8K296 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mtmr3Q8K296 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mtmr3Q8K296 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mtmr3Q8K296 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Mtmr3Q8K296 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mtmr3Q8K296 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mtmr3Q8K296 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mtmr3Q8K296 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mtmr3Q8K296 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mtmr3Q8K296 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mtmr3Q8K296 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mtmr3Q8K296 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mtmr3Q8K296 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms