Protein–RNA interactions for Protein: Q8K221

Arfip2, Arfaptin-2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip2Q8K221 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arfip2Q8K221 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arfip2Q8K221 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arfip2Q8K221 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arfip2Q8K221 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arfip2Q8K221 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arfip2Q8K221 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arfip2Q8K221 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arfip2Q8K221 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arfip2Q8K221 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Arfip2Q8K221 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arfip2Q8K221 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arfip2Q8K221 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arfip2Q8K221 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arfip2Q8K221 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arfip2Q8K221 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arfip2Q8K221 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arfip2Q8K221 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arfip2Q8K221 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arfip2Q8K221 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arfip2Q8K221 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arfip2Q8K221 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Arfip2Q8K221 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arfip2Q8K221 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arfip2Q8K221 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arfip2Q8K221 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arfip2Q8K221 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arfip2Q8K221 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arfip2Q8K221 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arfip2Q8K221 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfip2Q8K221 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfip2Q8K221 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfip2Q8K221 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfip2Q8K221 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfip2Q8K221 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfip2Q8K221 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfip2Q8K221 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfip2Q8K221 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfip2Q8K221 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfip2Q8K221 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfip2Q8K221 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfip2Q8K221 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arfip2Q8K221 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Arfip2Q8K221 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arfip2Q8K221 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arfip2Q8K221 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arfip2Q8K221 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arfip2Q8K221 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arfip2Q8K221 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arfip2Q8K221 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arfip2Q8K221 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arfip2Q8K221 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Arfip2Q8K221 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Arfip2Q8K221 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arfip2Q8K221 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Arfip2Q8K221 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Arfip2Q8K221 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arfip2Q8K221 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arfip2Q8K221 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arfip2Q8K221 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arfip2Q8K221 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arfip2Q8K221 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 218.4 ms