Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1C9

Lrrc41, Leucine-rich repeat-containing protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc41Q8K1C9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc41Q8K1C9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc41Q8K1C9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc41Q8K1C9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc41Q8K1C9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc41Q8K1C9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc41Q8K1C9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc41Q8K1C9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc41Q8K1C9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc41Q8K1C9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc41Q8K1C9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc41Q8K1C9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc41Q8K1C9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc41Q8K1C9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc41Q8K1C9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc41Q8K1C9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc41Q8K1C9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc41Q8K1C9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc41Q8K1C9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc41Q8K1C9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc41Q8K1C9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc41Q8K1C9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc41Q8K1C9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc41Q8K1C9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lrrc41Q8K1C9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lrrc41Q8K1C9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lrrc41Q8K1C9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lrrc41Q8K1C9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc41Q8K1C9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc41Q8K1C9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc41Q8K1C9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc41Q8K1C9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc41Q8K1C9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc41Q8K1C9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc41Q8K1C9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc41Q8K1C9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc41Q8K1C9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc41Q8K1C9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc41Q8K1C9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc41Q8K1C9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc41Q8K1C9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc41Q8K1C9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc41Q8K1C9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc41Q8K1C9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc41Q8K1C9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc41Q8K1C9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc41Q8K1C9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc41Q8K1C9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc41Q8K1C9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc41Q8K1C9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc41Q8K1C9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc41Q8K1C9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc41Q8K1C9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc41Q8K1C9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc41Q8K1C9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc41Q8K1C9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc41Q8K1C9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc41Q8K1C9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc41Q8K1C9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc41Q8K1C9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrrc41Q8K1C9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc41Q8K1C9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms