Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rab11fip3Q8CHD8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rab11fip3Q8CHD8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rab11fip3Q8CHD8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rab11fip3Q8CHD8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rab11fip3Q8CHD8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rab11fip3Q8CHD8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rab11fip3Q8CHD8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rab11fip3Q8CHD8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rab11fip3Q8CHD8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rab11fip3Q8CHD8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rab11fip3Q8CHD8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rab11fip3Q8CHD8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Rab11fip3Q8CHD8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rab11fip3Q8CHD8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rab11fip3Q8CHD8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rab11fip3Q8CHD8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rab11fip3Q8CHD8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rab11fip3Q8CHD8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rab11fip3Q8CHD8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rab11fip3Q8CHD8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rab11fip3Q8CHD8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rab11fip3Q8CHD8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rab11fip3Q8CHD8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rab11fip3Q8CHD8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rab11fip3Q8CHD8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rab11fip3Q8CHD8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rab11fip3Q8CHD8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Rab11fip3Q8CHD8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rab11fip3Q8CHD8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rab11fip3Q8CHD8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rab11fip3Q8CHD8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rab11fip3Q8CHD8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rab11fip3Q8CHD8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rab11fip3Q8CHD8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rab11fip3Q8CHD8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rab11fip3Q8CHD8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Rab11fip3Q8CHD8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rab11fip3Q8CHD8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rab11fip3Q8CHD8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rab11fip3Q8CHD8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rab11fip3Q8CHD8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rab11fip3Q8CHD8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rab11fip3Q8CHD8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rab11fip3Q8CHD8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rab11fip3Q8CHD8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rab11fip3Q8CHD8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rab11fip3Q8CHD8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rab11fip3Q8CHD8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rab11fip3Q8CHD8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rab11fip3Q8CHD8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rab11fip3Q8CHD8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rab11fip3Q8CHD8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rab11fip3Q8CHD8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Rab11fip3Q8CHD8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Rab11fip3Q8CHD8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Rab11fip3Q8CHD8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rab11fip3Q8CHD8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Rab11fip3Q8CHD8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rab11fip3Q8CHD8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rab11fip3Q8CHD8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rab11fip3Q8CHD8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rab11fip3Q8CHD8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Rab11fip3Q8CHD8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rab11fip3Q8CHD8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rab11fip3Q8CHD8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rab11fip3Q8CHD8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rab11fip3Q8CHD8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rab11fip3Q8CHD8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rab11fip3Q8CHD8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rab11fip3Q8CHD8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rab11fip3Q8CHD8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rab11fip3Q8CHD8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rab11fip3Q8CHD8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rab11fip3Q8CHD8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rab11fip3Q8CHD8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rab11fip3Q8CHD8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rab11fip3Q8CHD8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rab11fip3Q8CHD8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms