Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gpc3Q8CFZ4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gpc3Q8CFZ4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gpc3Q8CFZ4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gpc3Q8CFZ4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gpc3Q8CFZ4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gpc3Q8CFZ4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gpc3Q8CFZ4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gpc3Q8CFZ4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gpc3Q8CFZ4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gpc3Q8CFZ4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gpc3Q8CFZ4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gpc3Q8CFZ4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gpc3Q8CFZ4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gpc3Q8CFZ4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gpc3Q8CFZ4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gpc3Q8CFZ4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gpc3Q8CFZ4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gpc3Q8CFZ4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gpc3Q8CFZ4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gpc3Q8CFZ4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gpc3Q8CFZ4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gpc3Q8CFZ4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gpc3Q8CFZ4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gpc3Q8CFZ4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gpc3Q8CFZ4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gpc3Q8CFZ4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gpc3Q8CFZ4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gpc3Q8CFZ4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gpc3Q8CFZ4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gpc3Q8CFZ4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gpc3Q8CFZ4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gpc3Q8CFZ4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gpc3Q8CFZ4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gpc3Q8CFZ4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gpc3Q8CFZ4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gpc3Q8CFZ4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gpc3Q8CFZ4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gpc3Q8CFZ4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gpc3Q8CFZ4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gpc3Q8CFZ4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gpc3Q8CFZ4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gpc3Q8CFZ4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gpc3Q8CFZ4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gpc3Q8CFZ4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gpc3Q8CFZ4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gpc3Q8CFZ4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gpc3Q8CFZ4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gpc3Q8CFZ4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gpc3Q8CFZ4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gpc3Q8CFZ4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gpc3Q8CFZ4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gpc3Q8CFZ4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gpc3Q8CFZ4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gpc3Q8CFZ4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gpc3Q8CFZ4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gpc3Q8CFZ4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gpc3Q8CFZ4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gpc3Q8CFZ4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gpc3Q8CFZ4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gpc3Q8CFZ4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gpc3Q8CFZ4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gpc3Q8CFZ4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gpc3Q8CFZ4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gpc3Q8CFZ4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gpc3Q8CFZ4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpc3Q8CFZ4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 226.3 ms