Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx8Q8CFD4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx8Q8CFD4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx8Q8CFD4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx8Q8CFD4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx8Q8CFD4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx8Q8CFD4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx8Q8CFD4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx8Q8CFD4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx8Q8CFD4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx8Q8CFD4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx8Q8CFD4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx8Q8CFD4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx8Q8CFD4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx8Q8CFD4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx8Q8CFD4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx8Q8CFD4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx8Q8CFD4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx8Q8CFD4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx8Q8CFD4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx8Q8CFD4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx8Q8CFD4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx8Q8CFD4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx8Q8CFD4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx8Q8CFD4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx8Q8CFD4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx8Q8CFD4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx8Q8CFD4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx8Q8CFD4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx8Q8CFD4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx8Q8CFD4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx8Q8CFD4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx8Q8CFD4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx8Q8CFD4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx8Q8CFD4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx8Q8CFD4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx8Q8CFD4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx8Q8CFD4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx8Q8CFD4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx8Q8CFD4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Snx8Q8CFD4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx8Q8CFD4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx8Q8CFD4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx8Q8CFD4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx8Q8CFD4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx8Q8CFD4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx8Q8CFD4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx8Q8CFD4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx8Q8CFD4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx8Q8CFD4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx8Q8CFD4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx8Q8CFD4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx8Q8CFD4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx8Q8CFD4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx8Q8CFD4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms