Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc63Q8CDV6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc63Q8CDV6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc63Q8CDV6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc63Q8CDV6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc63Q8CDV6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc63Q8CDV6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc63Q8CDV6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc63Q8CDV6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc63Q8CDV6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc63Q8CDV6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc63Q8CDV6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc63Q8CDV6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc63Q8CDV6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc63Q8CDV6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc63Q8CDV6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc63Q8CDV6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc63Q8CDV6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc63Q8CDV6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc63Q8CDV6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc63Q8CDV6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc63Q8CDV6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc63Q8CDV6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc63Q8CDV6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc63Q8CDV6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc63Q8CDV6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc63Q8CDV6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc63Q8CDV6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc63Q8CDV6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc63Q8CDV6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc63Q8CDV6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc63Q8CDV6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc63Q8CDV6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc63Q8CDV6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc63Q8CDV6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc63Q8CDV6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc63Q8CDV6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc63Q8CDV6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc63Q8CDV6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc63Q8CDV6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc63Q8CDV6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc63Q8CDV6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc63Q8CDV6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc63Q8CDV6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc63Q8CDV6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc63Q8CDV6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc63Q8CDV6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc63Q8CDV6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc63Q8CDV6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc63Q8CDV6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc63Q8CDV6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc63Q8CDV6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc63Q8CDV6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc63Q8CDV6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc63Q8CDV6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc63Q8CDV6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc63Q8CDV6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc63Q8CDV6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc63Q8CDV6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc63Q8CDV6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc63Q8CDV6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc63Q8CDV6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc63Q8CDV6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc63Q8CDV6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc63Q8CDV6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc63Q8CDV6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc63Q8CDV6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc63Q8CDV6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms