Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ufl1Q8CCJ3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ufl1Q8CCJ3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ufl1Q8CCJ3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ufl1Q8CCJ3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ufl1Q8CCJ3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ufl1Q8CCJ3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ufl1Q8CCJ3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ufl1Q8CCJ3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ufl1Q8CCJ3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ufl1Q8CCJ3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ufl1Q8CCJ3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ufl1Q8CCJ3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ufl1Q8CCJ3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ufl1Q8CCJ3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ufl1Q8CCJ3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ufl1Q8CCJ3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ufl1Q8CCJ3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ufl1Q8CCJ3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ufl1Q8CCJ3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ufl1Q8CCJ3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ufl1Q8CCJ3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ufl1Q8CCJ3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ufl1Q8CCJ3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ufl1Q8CCJ3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ufl1Q8CCJ3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ufl1Q8CCJ3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ufl1Q8CCJ3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ufl1Q8CCJ3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ufl1Q8CCJ3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ufl1Q8CCJ3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ufl1Q8CCJ3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ufl1Q8CCJ3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ufl1Q8CCJ3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ufl1Q8CCJ3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ufl1Q8CCJ3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ufl1Q8CCJ3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ufl1Q8CCJ3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ufl1Q8CCJ3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ufl1Q8CCJ3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ufl1Q8CCJ3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ufl1Q8CCJ3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ufl1Q8CCJ3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ufl1Q8CCJ3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ufl1Q8CCJ3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ufl1Q8CCJ3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ufl1Q8CCJ3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ufl1Q8CCJ3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ufl1Q8CCJ3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ufl1Q8CCJ3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ufl1Q8CCJ3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ufl1Q8CCJ3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ufl1Q8CCJ3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ufl1Q8CCJ3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ufl1Q8CCJ3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ufl1Q8CCJ3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ufl1Q8CCJ3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ufl1Q8CCJ3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms