Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sfrp1Q8C4U3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sfrp1Q8C4U3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sfrp1Q8C4U3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sfrp1Q8C4U3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sfrp1Q8C4U3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sfrp1Q8C4U3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sfrp1Q8C4U3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sfrp1Q8C4U3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sfrp1Q8C4U3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sfrp1Q8C4U3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sfrp1Q8C4U3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sfrp1Q8C4U3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sfrp1Q8C4U3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sfrp1Q8C4U3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sfrp1Q8C4U3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sfrp1Q8C4U3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sfrp1Q8C4U3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sfrp1Q8C4U3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sfrp1Q8C4U3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sfrp1Q8C4U3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sfrp1Q8C4U3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Sfrp1Q8C4U3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sfrp1Q8C4U3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms