Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccser1Q8C0C4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccser1Q8C0C4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccser1Q8C0C4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccser1Q8C0C4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccser1Q8C0C4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccser1Q8C0C4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Ccser1Q8C0C4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Ccser1Q8C0C4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccser1Q8C0C4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccser1Q8C0C4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccser1Q8C0C4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccser1Q8C0C4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccser1Q8C0C4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccser1Q8C0C4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccser1Q8C0C4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccser1Q8C0C4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccser1Q8C0C4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccser1Q8C0C4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccser1Q8C0C4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccser1Q8C0C4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccser1Q8C0C4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccser1Q8C0C4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccser1Q8C0C4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccser1Q8C0C4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccser1Q8C0C4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccser1Q8C0C4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccser1Q8C0C4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccser1Q8C0C4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccser1Q8C0C4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccser1Q8C0C4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccser1Q8C0C4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccser1Q8C0C4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccser1Q8C0C4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccser1Q8C0C4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccser1Q8C0C4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccser1Q8C0C4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccser1Q8C0C4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccser1Q8C0C4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccser1Q8C0C4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccser1Q8C0C4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccser1Q8C0C4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccser1Q8C0C4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccser1Q8C0C4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccser1Q8C0C4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccser1Q8C0C4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccser1Q8C0C4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccser1Q8C0C4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccser1Q8C0C4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccser1Q8C0C4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccser1Q8C0C4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccser1Q8C0C4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccser1Q8C0C4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccser1Q8C0C4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccser1Q8C0C4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccser1Q8C0C4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccser1Q8C0C4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccser1Q8C0C4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccser1Q8C0C4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccser1Q8C0C4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccser1Q8C0C4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccser1Q8C0C4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccser1Q8C0C4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccser1Q8C0C4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccser1Q8C0C4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccser1Q8C0C4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccser1Q8C0C4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccser1Q8C0C4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccser1Q8C0C4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccser1Q8C0C4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccser1Q8C0C4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccser1Q8C0C4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccser1Q8C0C4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccser1Q8C0C4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccser1Q8C0C4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccser1Q8C0C4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccser1Q8C0C4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccser1Q8C0C4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccser1Q8C0C4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccser1Q8C0C4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccser1Q8C0C4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccser1Q8C0C4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccser1Q8C0C4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccser1Q8C0C4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccser1Q8C0C4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccser1Q8C0C4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccser1Q8C0C4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccser1Q8C0C4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccser1Q8C0C4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccser1Q8C0C4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccser1Q8C0C4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccser1Q8C0C4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccser1Q8C0C4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccser1Q8C0C4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccser1Q8C0C4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccser1Q8C0C4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccser1Q8C0C4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccser1Q8C0C4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccser1Q8C0C4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccser1Q8C0C4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
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