Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU27

Ppm1m, Protein phosphatase 1M, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1mQ8BU27 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ppm1mQ8BU27 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ppm1mQ8BU27 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ppm1mQ8BU27 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppm1mQ8BU27 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppm1mQ8BU27 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppm1mQ8BU27 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppm1mQ8BU27 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppm1mQ8BU27 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppm1mQ8BU27 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppm1mQ8BU27 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppm1mQ8BU27 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppm1mQ8BU27 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppm1mQ8BU27 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppm1mQ8BU27 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppm1mQ8BU27 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppm1mQ8BU27 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppm1mQ8BU27 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppm1mQ8BU27 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppm1mQ8BU27 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppm1mQ8BU27 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppm1mQ8BU27 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppm1mQ8BU27 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ppm1mQ8BU27 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ppm1mQ8BU27 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ppm1mQ8BU27 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ppm1mQ8BU27 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ppm1mQ8BU27 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ppm1mQ8BU27 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ppm1mQ8BU27 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ppm1mQ8BU27 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ppm1mQ8BU27 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ppm1mQ8BU27 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ppm1mQ8BU27 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppm1mQ8BU27 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppm1mQ8BU27 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppm1mQ8BU27 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ppm1mQ8BU27 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppm1mQ8BU27 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppm1mQ8BU27 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppm1mQ8BU27 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppm1mQ8BU27 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppm1mQ8BU27 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppm1mQ8BU27 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppm1mQ8BU27 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ppm1mQ8BU27 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ppm1mQ8BU27 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ppm1mQ8BU27 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ppm1mQ8BU27 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ppm1mQ8BU27 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppm1mQ8BU27 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppm1mQ8BU27 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppm1mQ8BU27 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppm1mQ8BU27 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppm1mQ8BU27 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppm1mQ8BU27 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppm1mQ8BU27 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppm1mQ8BU27 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppm1mQ8BU27 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppm1mQ8BU27 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppm1mQ8BU27 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppm1mQ8BU27 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppm1mQ8BU27 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppm1mQ8BU27 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppm1mQ8BU27 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppm1mQ8BU27 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppm1mQ8BU27 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppm1mQ8BU27 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ppm1mQ8BU27 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ppm1mQ8BU27 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ppm1mQ8BU27 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppm1mQ8BU27 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppm1mQ8BU27 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppm1mQ8BU27 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppm1mQ8BU27 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppm1mQ8BU27 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ppm1mQ8BU27 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppm1mQ8BU27 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppm1mQ8BU27 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppm1mQ8BU27 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppm1mQ8BU27 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppm1mQ8BU27 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppm1mQ8BU27 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ppm1mQ8BU27 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ppm1mQ8BU27 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ppm1mQ8BU27 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ppm1mQ8BU27 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ppm1mQ8BU27 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppm1mQ8BU27 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppm1mQ8BU27 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppm1mQ8BU27 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppm1mQ8BU27 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppm1mQ8BU27 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppm1mQ8BU27 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppm1mQ8BU27 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppm1mQ8BU27 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppm1mQ8BU27 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ppm1mQ8BU27 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ppm1mQ8BU27 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ppm1mQ8BU27 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms