Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU04

Ubr7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr7Q8BU04 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubr7Q8BU04 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubr7Q8BU04 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubr7Q8BU04 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubr7Q8BU04 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubr7Q8BU04 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubr7Q8BU04 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubr7Q8BU04 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubr7Q8BU04 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubr7Q8BU04 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubr7Q8BU04 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubr7Q8BU04 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubr7Q8BU04 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubr7Q8BU04 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubr7Q8BU04 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubr7Q8BU04 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubr7Q8BU04 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubr7Q8BU04 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubr7Q8BU04 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubr7Q8BU04 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubr7Q8BU04 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubr7Q8BU04 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubr7Q8BU04 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubr7Q8BU04 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubr7Q8BU04 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubr7Q8BU04 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubr7Q8BU04 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubr7Q8BU04 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubr7Q8BU04 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubr7Q8BU04 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubr7Q8BU04 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubr7Q8BU04 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubr7Q8BU04 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubr7Q8BU04 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubr7Q8BU04 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubr7Q8BU04 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubr7Q8BU04 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubr7Q8BU04 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubr7Q8BU04 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubr7Q8BU04 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubr7Q8BU04 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubr7Q8BU04 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubr7Q8BU04 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubr7Q8BU04 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubr7Q8BU04 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubr7Q8BU04 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubr7Q8BU04 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubr7Q8BU04 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubr7Q8BU04 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubr7Q8BU04 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubr7Q8BU04 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubr7Q8BU04 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubr7Q8BU04 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubr7Q8BU04 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubr7Q8BU04 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubr7Q8BU04 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubr7Q8BU04 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubr7Q8BU04 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubr7Q8BU04 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubr7Q8BU04 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubr7Q8BU04 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubr7Q8BU04 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubr7Q8BU04 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubr7Q8BU04 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubr7Q8BU04 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubr7Q8BU04 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubr7Q8BU04 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubr7Q8BU04 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ubr7Q8BU04 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubr7Q8BU04 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubr7Q8BU04 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubr7Q8BU04 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubr7Q8BU04 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubr7Q8BU04 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubr7Q8BU04 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubr7Q8BU04 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubr7Q8BU04 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubr7Q8BU04 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubr7Q8BU04 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubr7Q8BU04 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubr7Q8BU04 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubr7Q8BU04 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubr7Q8BU04 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubr7Q8BU04 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubr7Q8BU04 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubr7Q8BU04 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubr7Q8BU04 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubr7Q8BU04 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubr7Q8BU04 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubr7Q8BU04 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubr7Q8BU04 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubr7Q8BU04 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubr7Q8BU04 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubr7Q8BU04 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubr7Q8BU04 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubr7Q8BU04 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubr7Q8BU04 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubr7Q8BU04 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubr7Q8BU04 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ubr7Q8BU04 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms