Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ57

Gm10600, Predicted gene 10600, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10600Q8BQ57 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm10600Q8BQ57 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm10600Q8BQ57 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm10600Q8BQ57 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm10600Q8BQ57 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm10600Q8BQ57 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm10600Q8BQ57 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm10600Q8BQ57 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm10600Q8BQ57 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm10600Q8BQ57 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm10600Q8BQ57 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm10600Q8BQ57 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm10600Q8BQ57 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm10600Q8BQ57 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm10600Q8BQ57 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm10600Q8BQ57 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm10600Q8BQ57 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm10600Q8BQ57 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm10600Q8BQ57 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm10600Q8BQ57 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm10600Q8BQ57 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm10600Q8BQ57 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm10600Q8BQ57 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm10600Q8BQ57 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm10600Q8BQ57 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm10600Q8BQ57 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm10600Q8BQ57 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm10600Q8BQ57 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm10600Q8BQ57 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm10600Q8BQ57 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm10600Q8BQ57 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm10600Q8BQ57 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm10600Q8BQ57 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm10600Q8BQ57 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm10600Q8BQ57 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm10600Q8BQ57 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm10600Q8BQ57 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm10600Q8BQ57 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm10600Q8BQ57 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm10600Q8BQ57 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm10600Q8BQ57 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm10600Q8BQ57 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm10600Q8BQ57 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm10600Q8BQ57 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm10600Q8BQ57 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm10600Q8BQ57 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm10600Q8BQ57 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm10600Q8BQ57 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm10600Q8BQ57 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm10600Q8BQ57 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm10600Q8BQ57 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm10600Q8BQ57 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm10600Q8BQ57 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm10600Q8BQ57 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm10600Q8BQ57 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm10600Q8BQ57 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm10600Q8BQ57 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm10600Q8BQ57 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm10600Q8BQ57 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm10600Q8BQ57 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms