Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ47

Cnpy4, Protein canopy homolog 4, mousemouse

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy4Q8BQ47 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnpy4Q8BQ47 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnpy4Q8BQ47 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnpy4Q8BQ47 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnpy4Q8BQ47 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnpy4Q8BQ47 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnpy4Q8BQ47 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnpy4Q8BQ47 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnpy4Q8BQ47 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnpy4Q8BQ47 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnpy4Q8BQ47 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnpy4Q8BQ47 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnpy4Q8BQ47 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnpy4Q8BQ47 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnpy4Q8BQ47 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms