Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP27

Sfr1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfr1Q8BP27 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sfr1Q8BP27 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sfr1Q8BP27 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sfr1Q8BP27 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sfr1Q8BP27 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sfr1Q8BP27 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sfr1Q8BP27 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sfr1Q8BP27 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sfr1Q8BP27 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sfr1Q8BP27 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sfr1Q8BP27 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sfr1Q8BP27 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sfr1Q8BP27 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sfr1Q8BP27 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sfr1Q8BP27 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sfr1Q8BP27 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sfr1Q8BP27 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sfr1Q8BP27 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sfr1Q8BP27 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sfr1Q8BP27 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sfr1Q8BP27 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sfr1Q8BP27 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sfr1Q8BP27 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sfr1Q8BP27 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sfr1Q8BP27 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sfr1Q8BP27 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sfr1Q8BP27 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sfr1Q8BP27 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sfr1Q8BP27 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sfr1Q8BP27 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sfr1Q8BP27 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sfr1Q8BP27 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sfr1Q8BP27 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sfr1Q8BP27 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sfr1Q8BP27 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sfr1Q8BP27 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sfr1Q8BP27 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sfr1Q8BP27 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sfr1Q8BP27 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sfr1Q8BP27 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sfr1Q8BP27 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sfr1Q8BP27 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sfr1Q8BP27 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sfr1Q8BP27 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sfr1Q8BP27 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sfr1Q8BP27 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sfr1Q8BP27 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sfr1Q8BP27 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sfr1Q8BP27 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sfr1Q8BP27 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sfr1Q8BP27 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sfr1Q8BP27 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sfr1Q8BP27 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sfr1Q8BP27 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sfr1Q8BP27 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sfr1Q8BP27 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sfr1Q8BP27 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sfr1Q8BP27 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sfr1Q8BP27 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sfr1Q8BP27 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sfr1Q8BP27 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms