Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIF2

Rbfox3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbfox3Q8BIF2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbfox3Q8BIF2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbfox3Q8BIF2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbfox3Q8BIF2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbfox3Q8BIF2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbfox3Q8BIF2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbfox3Q8BIF2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbfox3Q8BIF2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbfox3Q8BIF2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbfox3Q8BIF2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbfox3Q8BIF2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbfox3Q8BIF2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbfox3Q8BIF2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbfox3Q8BIF2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbfox3Q8BIF2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbfox3Q8BIF2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbfox3Q8BIF2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbfox3Q8BIF2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbfox3Q8BIF2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbfox3Q8BIF2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbfox3Q8BIF2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbfox3Q8BIF2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbfox3Q8BIF2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbfox3Q8BIF2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbfox3Q8BIF2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbfox3Q8BIF2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbfox3Q8BIF2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbfox3Q8BIF2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbfox3Q8BIF2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbfox3Q8BIF2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbfox3Q8BIF2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbfox3Q8BIF2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbfox3Q8BIF2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbfox3Q8BIF2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rbfox3Q8BIF2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbfox3Q8BIF2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbfox3Q8BIF2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbfox3Q8BIF2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbfox3Q8BIF2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbfox3Q8BIF2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbfox3Q8BIF2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbfox3Q8BIF2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbfox3Q8BIF2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbfox3Q8BIF2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbfox3Q8BIF2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbfox3Q8BIF2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbfox3Q8BIF2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbfox3Q8BIF2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbfox3Q8BIF2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbfox3Q8BIF2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbfox3Q8BIF2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbfox3Q8BIF2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbfox3Q8BIF2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms