Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trmt12Q8BG71 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trmt12Q8BG71 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trmt12Q8BG71 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trmt12Q8BG71 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trmt12Q8BG71 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trmt12Q8BG71 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trmt12Q8BG71 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trmt12Q8BG71 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trmt12Q8BG71 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trmt12Q8BG71 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trmt12Q8BG71 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trmt12Q8BG71 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trmt12Q8BG71 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trmt12Q8BG71 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trmt12Q8BG71 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trmt12Q8BG71 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trmt12Q8BG71 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trmt12Q8BG71 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trmt12Q8BG71 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trmt12Q8BG71 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trmt12Q8BG71 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.9 ms