Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW5

Whrn, Whirlin, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhrnQ80VW5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WhrnQ80VW5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
WhrnQ80VW5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WhrnQ80VW5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WhrnQ80VW5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WhrnQ80VW5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WhrnQ80VW5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WhrnQ80VW5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
WhrnQ80VW5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WhrnQ80VW5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WhrnQ80VW5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WhrnQ80VW5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WhrnQ80VW5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WhrnQ80VW5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
WhrnQ80VW5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WhrnQ80VW5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WhrnQ80VW5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WhrnQ80VW5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WhrnQ80VW5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WhrnQ80VW5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WhrnQ80VW5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
WhrnQ80VW5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
WhrnQ80VW5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WhrnQ80VW5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WhrnQ80VW5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WhrnQ80VW5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WhrnQ80VW5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WhrnQ80VW5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WhrnQ80VW5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WhrnQ80VW5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WhrnQ80VW5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
WhrnQ80VW5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
WhrnQ80VW5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
WhrnQ80VW5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WhrnQ80VW5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
WhrnQ80VW5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WhrnQ80VW5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WhrnQ80VW5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WhrnQ80VW5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WhrnQ80VW5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WhrnQ80VW5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WhrnQ80VW5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WhrnQ80VW5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WhrnQ80VW5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WhrnQ80VW5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WhrnQ80VW5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WhrnQ80VW5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WhrnQ80VW5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WhrnQ80VW5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WhrnQ80VW5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WhrnQ80VW5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WhrnQ80VW5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WhrnQ80VW5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WhrnQ80VW5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WhrnQ80VW5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WhrnQ80VW5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WhrnQ80VW5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WhrnQ80VW5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WhrnQ80VW5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WhrnQ80VW5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WhrnQ80VW5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WhrnQ80VW5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
WhrnQ80VW5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WhrnQ80VW5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WhrnQ80VW5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
WhrnQ80VW5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
WhrnQ80VW5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
WhrnQ80VW5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
WhrnQ80VW5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WhrnQ80VW5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms