Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ube3cQ80U95 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ube3cQ80U95 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ube3cQ80U95 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ube3cQ80U95 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ube3cQ80U95 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ube3cQ80U95 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ube3cQ80U95 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ube3cQ80U95 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ube3cQ80U95 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ube3cQ80U95 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ube3cQ80U95 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ube3cQ80U95 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ube3cQ80U95 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ube3cQ80U95 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ube3cQ80U95 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ube3cQ80U95 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ube3cQ80U95 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ube3cQ80U95 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ube3cQ80U95 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ube3cQ80U95 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ube3cQ80U95 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ube3cQ80U95 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ube3cQ80U95 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ube3cQ80U95 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ube3cQ80U95 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ube3cQ80U95 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ube3cQ80U95 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ube3cQ80U95 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ube3cQ80U95 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ube3cQ80U95 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ube3cQ80U95 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ube3cQ80U95 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ube3cQ80U95 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ube3cQ80U95 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ube3cQ80U95 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ube3cQ80U95 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ube3cQ80U95 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ube3cQ80U95 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ube3cQ80U95 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ube3cQ80U95 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ube3cQ80U95 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ube3cQ80U95 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ube3cQ80U95 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ube3cQ80U95 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ube3cQ80U95 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ube3cQ80U95 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ube3cQ80U95 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ube3cQ80U95 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ube3cQ80U95 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ube3cQ80U95 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ube3cQ80U95 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ube3cQ80U95 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ube3cQ80U95 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ube3cQ80U95 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ube3cQ80U95 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ube3cQ80U95 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ube3cQ80U95 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ube3cQ80U95 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ube3cQ80U95 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ube3cQ80U95 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ube3cQ80U95 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ube3cQ80U95 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ube3cQ80U95 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ube3cQ80U95 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ube3cQ80U95 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ube3cQ80U95 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ube3cQ80U95 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ube3cQ80U95 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ube3cQ80U95 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ube3cQ80U95 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ube3cQ80U95 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ube3cQ80U95 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ube3cQ80U95 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ube3cQ80U95 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ube3cQ80U95 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ube3cQ80U95 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ube3cQ80U95 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ube3cQ80U95 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ube3cQ80U95 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ube3cQ80U95 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ube3cQ80U95 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ube3cQ80U95 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ube3cQ80U95 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ube3cQ80U95 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ube3cQ80U95 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ube3cQ80U95 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ube3cQ80U95 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ube3cQ80U95 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ube3cQ80U95 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ube3cQ80U95 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ube3cQ80U95 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ube3cQ80U95 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ube3cQ80U95 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ube3cQ80U95 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ube3cQ80U95 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ube3cQ80U95 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ube3cQ80U95 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ube3cQ80U95 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ube3cQ80U95 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms