Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pja2Q80U04 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pja2Q80U04 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pja2Q80U04 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pja2Q80U04 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pja2Q80U04 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pja2Q80U04 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pja2Q80U04 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pja2Q80U04 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pja2Q80U04 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pja2Q80U04 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pja2Q80U04 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pja2Q80U04 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pja2Q80U04 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pja2Q80U04 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pja2Q80U04 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pja2Q80U04 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pja2Q80U04 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pja2Q80U04 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pja2Q80U04 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pja2Q80U04 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pja2Q80U04 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pja2Q80U04 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pja2Q80U04 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pja2Q80U04 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pja2Q80U04 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pja2Q80U04 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pja2Q80U04 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pja2Q80U04 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pja2Q80U04 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pja2Q80U04 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pja2Q80U04 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pja2Q80U04 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pja2Q80U04 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pja2Q80U04 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pja2Q80U04 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pja2Q80U04 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pja2Q80U04 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pja2Q80U04 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pja2Q80U04 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pja2Q80U04 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pja2Q80U04 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pja2Q80U04 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pja2Q80U04 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pja2Q80U04 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pja2Q80U04 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pja2Q80U04 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pja2Q80U04 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pja2Q80U04 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pja2Q80U04 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pja2Q80U04 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pja2Q80U04 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pja2Q80U04 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pja2Q80U04 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pja2Q80U04 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pja2Q80U04 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pja2Q80U04 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pja2Q80U04 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pja2Q80U04 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pja2Q80U04 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pja2Q80U04 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pja2Q80U04 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pja2Q80U04 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pja2Q80U04 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pja2Q80U04 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pja2Q80U04 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pja2Q80U04 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pja2Q80U04 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pja2Q80U04 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pja2Q80U04 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pja2Q80U04 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pja2Q80U04 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pja2Q80U04 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pja2Q80U04 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pja2Q80U04 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pja2Q80U04 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pja2Q80U04 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pja2Q80U04 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pja2Q80U04 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pja2Q80U04 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pja2Q80U04 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pja2Q80U04 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pja2Q80U04 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pja2Q80U04 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pja2Q80U04 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pja2Q80U04 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pja2Q80U04 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pja2Q80U04 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pja2Q80U04 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pja2Q80U04 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pja2Q80U04 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pja2Q80U04 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pja2Q80U04 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pja2Q80U04 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pja2Q80U04 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pja2Q80U04 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pja2Q80U04 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pja2Q80U04 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pja2Q80U04 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pja2Q80U04 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms