Protein–RNA interactions for Protein: Q80TV8

Clasp1, CLIP-associating protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clasp1Q80TV8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Clasp1Q80TV8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Clasp1Q80TV8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Clasp1Q80TV8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Clasp1Q80TV8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Clasp1Q80TV8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Clasp1Q80TV8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Clasp1Q80TV8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Clasp1Q80TV8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Clasp1Q80TV8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Clasp1Q80TV8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Clasp1Q80TV8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Clasp1Q80TV8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Clasp1Q80TV8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Clasp1Q80TV8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Clasp1Q80TV8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Clasp1Q80TV8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Clasp1Q80TV8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Clasp1Q80TV8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Clasp1Q80TV8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Clasp1Q80TV8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Clasp1Q80TV8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Clasp1Q80TV8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Clasp1Q80TV8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Clasp1Q80TV8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Clasp1Q80TV8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Clasp1Q80TV8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Clasp1Q80TV8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Clasp1Q80TV8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Clasp1Q80TV8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Clasp1Q80TV8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Clasp1Q80TV8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Clasp1Q80TV8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Clasp1Q80TV8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Clasp1Q80TV8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Clasp1Q80TV8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Clasp1Q80TV8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Clasp1Q80TV8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Clasp1Q80TV8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Clasp1Q80TV8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Clasp1Q80TV8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Clasp1Q80TV8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Clasp1Q80TV8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Clasp1Q80TV8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Clasp1Q80TV8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Clasp1Q80TV8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Clasp1Q80TV8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Clasp1Q80TV8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Clasp1Q80TV8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Clasp1Q80TV8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Clasp1Q80TV8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Clasp1Q80TV8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Clasp1Q80TV8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Clasp1Q80TV8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Clasp1Q80TV8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Clasp1Q80TV8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
Clasp1Q80TV8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Clasp1Q80TV8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Clasp1Q80TV8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Clasp1Q80TV8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Clasp1Q80TV8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Clasp1Q80TV8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Clasp1Q80TV8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Clasp1Q80TV8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Clasp1Q80TV8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Clasp1Q80TV8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Clasp1Q80TV8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
Clasp1Q80TV8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Clasp1Q80TV8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Clasp1Q80TV8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Clasp1Q80TV8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Clasp1Q80TV8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Clasp1Q80TV8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Clasp1Q80TV8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Clasp1Q80TV8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Clasp1Q80TV8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Clasp1Q80TV8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Clasp1Q80TV8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Clasp1Q80TV8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Clasp1Q80TV8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Clasp1Q80TV8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Clasp1Q80TV8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Clasp1Q80TV8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Clasp1Q80TV8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Clasp1Q80TV8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Clasp1Q80TV8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Clasp1Q80TV8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Clasp1Q80TV8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Clasp1Q80TV8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Clasp1Q80TV8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Clasp1Q80TV8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Clasp1Q80TV8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Clasp1Q80TV8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Clasp1Q80TV8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Clasp1Q80TV8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Clasp1Q80TV8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Clasp1Q80TV8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Clasp1Q80TV8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Clasp1Q80TV8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Clasp1Q80TV8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms