Protein–RNA interactions for Protein: Q80T74

Klhl29, Kelch-like protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl29Q80T74 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Klhl29Q80T74 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhl29Q80T74 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl29Q80T74 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl29Q80T74 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl29Q80T74 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl29Q80T74 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl29Q80T74 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl29Q80T74 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl29Q80T74 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl29Q80T74 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl29Q80T74 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl29Q80T74 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms