Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSP5

Vtcn1, V-set domain containing T-cell activation inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vtcn1Q7TSP5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vtcn1Q7TSP5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vtcn1Q7TSP5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vtcn1Q7TSP5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vtcn1Q7TSP5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vtcn1Q7TSP5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vtcn1Q7TSP5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vtcn1Q7TSP5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vtcn1Q7TSP5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vtcn1Q7TSP5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vtcn1Q7TSP5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vtcn1Q7TSP5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vtcn1Q7TSP5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vtcn1Q7TSP5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vtcn1Q7TSP5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vtcn1Q7TSP5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vtcn1Q7TSP5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vtcn1Q7TSP5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vtcn1Q7TSP5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vtcn1Q7TSP5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vtcn1Q7TSP5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vtcn1Q7TSP5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vtcn1Q7TSP5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vtcn1Q7TSP5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vtcn1Q7TSP5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vtcn1Q7TSP5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vtcn1Q7TSP5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vtcn1Q7TSP5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Vtcn1Q7TSP5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vtcn1Q7TSP5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vtcn1Q7TSP5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vtcn1Q7TSP5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vtcn1Q7TSP5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vtcn1Q7TSP5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.5 ms