Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Ccp110Q7TSH4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Ccp110Q7TSH4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Ccp110Q7TSH4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Ccp110Q7TSH4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Ccp110Q7TSH4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Ccp110Q7TSH4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Ccp110Q7TSH4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Ccp110Q7TSH4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Ccp110Q7TSH4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Ccp110Q7TSH4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25,48■■□□□ 1,67
Ccp110Q7TSH4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Ccp110Q7TSH4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Ccp110Q7TSH4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Ccp110Q7TSH4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Ccp110Q7TSH4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Ccp110Q7TSH4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Ccp110Q7TSH4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Ccp110Q7TSH4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Ccp110Q7TSH4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Ccp110Q7TSH4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Ccp110Q7TSH4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Ccp110Q7TSH4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25,47■■□□□ 1,67
Ccp110Q7TSH4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Ccp110Q7TSH4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Ccp110Q7TSH4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,67
Ccp110Q7TSH4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Ccp110Q7TSH4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Ccp110Q7TSH4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Ccp110Q7TSH4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Ccp110Q7TSH4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Ccp110Q7TSH4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Ccp110Q7TSH4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Ccp110Q7TSH4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Ccp110Q7TSH4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Ccp110Q7TSH4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Ccp110Q7TSH4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Ccp110Q7TSH4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Ccp110Q7TSH4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Ccp110Q7TSH4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Ccp110Q7TSH4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Ccp110Q7TSH4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Ccp110Q7TSH4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Ccp110Q7TSH4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Ccp110Q7TSH4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Ccp110Q7TSH4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Ccp110Q7TSH4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Ccp110Q7TSH4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Ccp110Q7TSH4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Ccp110Q7TSH4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Ccp110Q7TSH4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Ccp110Q7TSH4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25,42■■□□□ 1,66
Ccp110Q7TSH4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Ccp110Q7TSH4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Ccp110Q7TSH4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25,41■■□□□ 1,66
Ccp110Q7TSH4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Ccp110Q7TSH4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Ccp110Q7TSH4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Ccp110Q7TSH4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Ccp110Q7TSH4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Ccp110Q7TSH4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25,39■■□□□ 1,66
Ccp110Q7TSH4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25,39■■□□□ 1,66
Ccp110Q7TSH4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Ccp110Q7TSH4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Ccp110Q7TSH4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Ccp110Q7TSH4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Ccp110Q7TSH4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Ccp110Q7TSH4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Ccp110Q7TSH4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Ccp110Q7TSH4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Ccp110Q7TSH4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Ccp110Q7TSH4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Ccp110Q7TSH4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Ccp110Q7TSH4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Ccp110Q7TSH4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Ccp110Q7TSH4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Ccp110Q7TSH4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Ccp110Q7TSH4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Ccp110Q7TSH4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Ccp110Q7TSH4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Ccp110Q7TSH4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Ccp110Q7TSH4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Ccp110Q7TSH4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Ccp110Q7TSH4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Ccp110Q7TSH4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Ccp110Q7TSH4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Ccp110Q7TSH4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Ccp110Q7TSH4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Ccp110Q7TSH4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Ccp110Q7TSH4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Ccp110Q7TSH4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Ccp110Q7TSH4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Ccp110Q7TSH4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Ccp110Q7TSH4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Ccp110Q7TSH4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Ccp110Q7TSH4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,64
Ccp110Q7TSH4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Ccp110Q7TSH4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25,32■■□□□ 1,64
Ccp110Q7TSH4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Ccp110Q7TSH4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23,2 ms