Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dsg1bQ7TSF1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dsg1bQ7TSF1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dsg1bQ7TSF1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dsg1bQ7TSF1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dsg1bQ7TSF1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dsg1bQ7TSF1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dsg1bQ7TSF1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dsg1bQ7TSF1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dsg1bQ7TSF1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dsg1bQ7TSF1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dsg1bQ7TSF1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dsg1bQ7TSF1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dsg1bQ7TSF1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dsg1bQ7TSF1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dsg1bQ7TSF1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dsg1bQ7TSF1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dsg1bQ7TSF1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dsg1bQ7TSF1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Dsg1bQ7TSF1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dsg1bQ7TSF1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dsg1bQ7TSF1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dsg1bQ7TSF1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dsg1bQ7TSF1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Dsg1bQ7TSF1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dsg1bQ7TSF1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dsg1bQ7TSF1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dsg1bQ7TSF1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dsg1bQ7TSF1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dsg1bQ7TSF1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dsg1bQ7TSF1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dsg1bQ7TSF1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dsg1bQ7TSF1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dsg1bQ7TSF1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dsg1bQ7TSF1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dsg1bQ7TSF1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Dsg1bQ7TSF1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dsg1bQ7TSF1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dsg1bQ7TSF1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dsg1bQ7TSF1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dsg1bQ7TSF1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dsg1bQ7TSF1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dsg1bQ7TSF1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dsg1bQ7TSF1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dsg1bQ7TSF1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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