Protein–RNA interactions for Protein: Q7TND5

Rpf1, Ribosome production factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf1Q7TND5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rpf1Q7TND5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpf1Q7TND5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpf1Q7TND5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpf1Q7TND5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpf1Q7TND5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpf1Q7TND5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpf1Q7TND5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpf1Q7TND5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpf1Q7TND5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpf1Q7TND5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpf1Q7TND5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpf1Q7TND5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpf1Q7TND5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpf1Q7TND5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpf1Q7TND5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpf1Q7TND5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpf1Q7TND5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpf1Q7TND5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpf1Q7TND5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpf1Q7TND5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpf1Q7TND5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpf1Q7TND5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpf1Q7TND5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpf1Q7TND5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpf1Q7TND5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpf1Q7TND5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpf1Q7TND5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpf1Q7TND5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpf1Q7TND5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpf1Q7TND5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpf1Q7TND5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpf1Q7TND5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpf1Q7TND5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpf1Q7TND5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpf1Q7TND5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpf1Q7TND5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpf1Q7TND5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpf1Q7TND5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpf1Q7TND5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpf1Q7TND5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpf1Q7TND5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpf1Q7TND5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpf1Q7TND5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpf1Q7TND5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpf1Q7TND5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpf1Q7TND5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpf1Q7TND5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpf1Q7TND5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpf1Q7TND5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpf1Q7TND5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpf1Q7TND5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpf1Q7TND5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms