Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GypcQ78HU7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GypcQ78HU7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GypcQ78HU7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GypcQ78HU7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GypcQ78HU7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GypcQ78HU7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GypcQ78HU7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GypcQ78HU7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GypcQ78HU7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GypcQ78HU7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GypcQ78HU7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GypcQ78HU7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GypcQ78HU7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GypcQ78HU7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GypcQ78HU7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GypcQ78HU7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GypcQ78HU7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GypcQ78HU7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GypcQ78HU7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GypcQ78HU7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GypcQ78HU7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GypcQ78HU7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GypcQ78HU7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GypcQ78HU7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GypcQ78HU7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GypcQ78HU7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GypcQ78HU7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GypcQ78HU7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GypcQ78HU7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GypcQ78HU7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GypcQ78HU7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GypcQ78HU7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GypcQ78HU7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GypcQ78HU7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GypcQ78HU7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GypcQ78HU7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GypcQ78HU7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GypcQ78HU7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GypcQ78HU7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GypcQ78HU7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GypcQ78HU7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GypcQ78HU7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GypcQ78HU7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GypcQ78HU7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GypcQ78HU7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GypcQ78HU7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GypcQ78HU7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GypcQ78HU7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GypcQ78HU7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GypcQ78HU7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GypcQ78HU7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GypcQ78HU7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GypcQ78HU7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GypcQ78HU7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GypcQ78HU7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GypcQ78HU7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GypcQ78HU7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GypcQ78HU7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GypcQ78HU7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GypcQ78HU7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GypcQ78HU7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GypcQ78HU7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GypcQ78HU7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GypcQ78HU7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GypcQ78HU7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GypcQ78HU7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GypcQ78HU7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GypcQ78HU7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GypcQ78HU7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GypcQ78HU7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GypcQ78HU7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GypcQ78HU7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GypcQ78HU7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GypcQ78HU7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GypcQ78HU7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GypcQ78HU7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GypcQ78HU7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GypcQ78HU7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GypcQ78HU7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GypcQ78HU7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GypcQ78HU7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GypcQ78HU7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GypcQ78HU7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GypcQ78HU7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GypcQ78HU7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GypcQ78HU7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GypcQ78HU7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GypcQ78HU7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GypcQ78HU7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GypcQ78HU7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GypcQ78HU7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GypcQ78HU7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GypcQ78HU7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GypcQ78HU7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GypcQ78HU7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GypcQ78HU7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GypcQ78HU7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GypcQ78HU7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GypcQ78HU7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms