Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY3

Rps27l, 40S ribosomal protein S27-like, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27lQ6ZWY3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rps27lQ6ZWY3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rps27lQ6ZWY3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rps27lQ6ZWY3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rps27lQ6ZWY3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rps27lQ6ZWY3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rps27lQ6ZWY3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rps27lQ6ZWY3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rps27lQ6ZWY3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rps27lQ6ZWY3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rps27lQ6ZWY3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rps27lQ6ZWY3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rps27lQ6ZWY3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rps27lQ6ZWY3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps27lQ6ZWY3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps27lQ6ZWY3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps27lQ6ZWY3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps27lQ6ZWY3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps27lQ6ZWY3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rps27lQ6ZWY3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rps27lQ6ZWY3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rps27lQ6ZWY3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rps27lQ6ZWY3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps27lQ6ZWY3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps27lQ6ZWY3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps27lQ6ZWY3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps27lQ6ZWY3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps27lQ6ZWY3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps27lQ6ZWY3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps27lQ6ZWY3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps27lQ6ZWY3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps27lQ6ZWY3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps27lQ6ZWY3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps27lQ6ZWY3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps27lQ6ZWY3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps27lQ6ZWY3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps27lQ6ZWY3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rps27lQ6ZWY3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rps27lQ6ZWY3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Rps27lQ6ZWY3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rps27lQ6ZWY3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rps27lQ6ZWY3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps27lQ6ZWY3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rps27lQ6ZWY3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rps27lQ6ZWY3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps27lQ6ZWY3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps27lQ6ZWY3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rps27lQ6ZWY3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps27lQ6ZWY3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rps27lQ6ZWY3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps27lQ6ZWY3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps27lQ6ZWY3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps27lQ6ZWY3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rps27lQ6ZWY3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps27lQ6ZWY3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps27lQ6ZWY3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rps27lQ6ZWY3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rps27lQ6ZWY3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps27lQ6ZWY3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps27lQ6ZWY3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rps27lQ6ZWY3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps27lQ6ZWY3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms