Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chsy1Q6ZQ11 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chsy1Q6ZQ11 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chsy1Q6ZQ11 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chsy1Q6ZQ11 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chsy1Q6ZQ11 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chsy1Q6ZQ11 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chsy1Q6ZQ11 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chsy1Q6ZQ11 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chsy1Q6ZQ11 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chsy1Q6ZQ11 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Chsy1Q6ZQ11 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chsy1Q6ZQ11 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chsy1Q6ZQ11 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chsy1Q6ZQ11 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chsy1Q6ZQ11 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chsy1Q6ZQ11 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chsy1Q6ZQ11 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chsy1Q6ZQ11 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chsy1Q6ZQ11 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chsy1Q6ZQ11 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chsy1Q6ZQ11 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Chsy1Q6ZQ11 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chsy1Q6ZQ11 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chsy1Q6ZQ11 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chsy1Q6ZQ11 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chsy1Q6ZQ11 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chsy1Q6ZQ11 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chsy1Q6ZQ11 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chsy1Q6ZQ11 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chsy1Q6ZQ11 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chsy1Q6ZQ11 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chsy1Q6ZQ11 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Chsy1Q6ZQ11 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chsy1Q6ZQ11 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chsy1Q6ZQ11 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Chsy1Q6ZQ11 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chsy1Q6ZQ11 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chsy1Q6ZQ11 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chsy1Q6ZQ11 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chsy1Q6ZQ11 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chsy1Q6ZQ11 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chsy1Q6ZQ11 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chsy1Q6ZQ11 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chsy1Q6ZQ11 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chsy1Q6ZQ11 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chsy1Q6ZQ11 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chsy1Q6ZQ11 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chsy1Q6ZQ11 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chsy1Q6ZQ11 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chsy1Q6ZQ11 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chsy1Q6ZQ11 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chsy1Q6ZQ11 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Chsy1Q6ZQ11 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chsy1Q6ZQ11 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Chsy1Q6ZQ11 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Chsy1Q6ZQ11 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chsy1Q6ZQ11 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chsy1Q6ZQ11 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chsy1Q6ZQ11 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chsy1Q6ZQ11 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chsy1Q6ZQ11 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chsy1Q6ZQ11 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chsy1Q6ZQ11 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chsy1Q6ZQ11 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chsy1Q6ZQ11 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chsy1Q6ZQ11 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chsy1Q6ZQ11 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chsy1Q6ZQ11 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chsy1Q6ZQ11 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chsy1Q6ZQ11 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chsy1Q6ZQ11 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chsy1Q6ZQ11 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chsy1Q6ZQ11 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chsy1Q6ZQ11 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chsy1Q6ZQ11 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chsy1Q6ZQ11 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chsy1Q6ZQ11 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chsy1Q6ZQ11 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chsy1Q6ZQ11 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chsy1Q6ZQ11 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chsy1Q6ZQ11 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chsy1Q6ZQ11 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chsy1Q6ZQ11 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chsy1Q6ZQ11 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chsy1Q6ZQ11 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chsy1Q6ZQ11 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chsy1Q6ZQ11 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chsy1Q6ZQ11 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chsy1Q6ZQ11 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chsy1Q6ZQ11 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chsy1Q6ZQ11 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chsy1Q6ZQ11 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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