Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPJ3

Ube2o, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme UBE2O, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2oQ6ZPJ3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ube2oQ6ZPJ3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ube2oQ6ZPJ3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ube2oQ6ZPJ3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ube2oQ6ZPJ3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ube2oQ6ZPJ3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ube2oQ6ZPJ3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ube2oQ6ZPJ3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ube2oQ6ZPJ3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ube2oQ6ZPJ3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ube2oQ6ZPJ3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ube2oQ6ZPJ3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ube2oQ6ZPJ3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ube2oQ6ZPJ3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ube2oQ6ZPJ3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ube2oQ6ZPJ3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ube2oQ6ZPJ3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ube2oQ6ZPJ3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ube2oQ6ZPJ3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ube2oQ6ZPJ3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube2oQ6ZPJ3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube2oQ6ZPJ3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube2oQ6ZPJ3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube2oQ6ZPJ3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube2oQ6ZPJ3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube2oQ6ZPJ3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube2oQ6ZPJ3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ube2oQ6ZPJ3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ube2oQ6ZPJ3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ube2oQ6ZPJ3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ube2oQ6ZPJ3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube2oQ6ZPJ3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube2oQ6ZPJ3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube2oQ6ZPJ3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube2oQ6ZPJ3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube2oQ6ZPJ3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube2oQ6ZPJ3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube2oQ6ZPJ3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube2oQ6ZPJ3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube2oQ6ZPJ3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ube2oQ6ZPJ3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ube2oQ6ZPJ3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ube2oQ6ZPJ3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ube2oQ6ZPJ3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ube2oQ6ZPJ3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube2oQ6ZPJ3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube2oQ6ZPJ3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube2oQ6ZPJ3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube2oQ6ZPJ3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube2oQ6ZPJ3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube2oQ6ZPJ3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube2oQ6ZPJ3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube2oQ6ZPJ3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ube2oQ6ZPJ3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ube2oQ6ZPJ3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ube2oQ6ZPJ3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ube2oQ6ZPJ3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ube2oQ6ZPJ3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ube2oQ6ZPJ3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ube2oQ6ZPJ3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ube2oQ6ZPJ3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ube2oQ6ZPJ3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ube2oQ6ZPJ3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ube2oQ6ZPJ3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ube2oQ6ZPJ3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ube2oQ6ZPJ3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ube2oQ6ZPJ3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ube2oQ6ZPJ3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ube2oQ6ZPJ3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ube2oQ6ZPJ3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ube2oQ6ZPJ3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ube2oQ6ZPJ3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ube2oQ6ZPJ3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ube2oQ6ZPJ3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ube2oQ6ZPJ3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ube2oQ6ZPJ3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ube2oQ6ZPJ3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ube2oQ6ZPJ3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ube2oQ6ZPJ3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ube2oQ6ZPJ3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ube2oQ6ZPJ3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ube2oQ6ZPJ3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ube2oQ6ZPJ3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ube2oQ6ZPJ3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ube2oQ6ZPJ3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ube2oQ6ZPJ3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ube2oQ6ZPJ3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ube2oQ6ZPJ3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ube2oQ6ZPJ3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ube2oQ6ZPJ3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ube2oQ6ZPJ3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ube2oQ6ZPJ3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ube2oQ6ZPJ3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ube2oQ6ZPJ3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 264.1 ms