Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gramd2bQ6PEM6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gramd2bQ6PEM6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gramd2bQ6PEM6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gramd2bQ6PEM6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gramd2bQ6PEM6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gramd2bQ6PEM6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gramd2bQ6PEM6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gramd2bQ6PEM6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gramd2bQ6PEM6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gramd2bQ6PEM6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gramd2bQ6PEM6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gramd2bQ6PEM6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gramd2bQ6PEM6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gramd2bQ6PEM6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gramd2bQ6PEM6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gramd2bQ6PEM6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gramd2bQ6PEM6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gramd2bQ6PEM6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gramd2bQ6PEM6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gramd2bQ6PEM6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gramd2bQ6PEM6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms