Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CtifQ6PEE2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CtifQ6PEE2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CtifQ6PEE2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CtifQ6PEE2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CtifQ6PEE2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CtifQ6PEE2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CtifQ6PEE2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CtifQ6PEE2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CtifQ6PEE2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CtifQ6PEE2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CtifQ6PEE2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CtifQ6PEE2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CtifQ6PEE2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CtifQ6PEE2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CtifQ6PEE2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CtifQ6PEE2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CtifQ6PEE2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CtifQ6PEE2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CtifQ6PEE2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CtifQ6PEE2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CtifQ6PEE2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CtifQ6PEE2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CtifQ6PEE2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CtifQ6PEE2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CtifQ6PEE2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CtifQ6PEE2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CtifQ6PEE2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CtifQ6PEE2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CtifQ6PEE2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CtifQ6PEE2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CtifQ6PEE2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CtifQ6PEE2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CtifQ6PEE2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CtifQ6PEE2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CtifQ6PEE2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CtifQ6PEE2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtifQ6PEE2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtifQ6PEE2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtifQ6PEE2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtifQ6PEE2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtifQ6PEE2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtifQ6PEE2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtifQ6PEE2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtifQ6PEE2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtifQ6PEE2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtifQ6PEE2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtifQ6PEE2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CtifQ6PEE2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CtifQ6PEE2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CtifQ6PEE2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CtifQ6PEE2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CtifQ6PEE2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CtifQ6PEE2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CtifQ6PEE2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CtifQ6PEE2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CtifQ6PEE2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CtifQ6PEE2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CtifQ6PEE2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CtifQ6PEE2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CtifQ6PEE2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CtifQ6PEE2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CtifQ6PEE2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CtifQ6PEE2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CtifQ6PEE2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CtifQ6PEE2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CtifQ6PEE2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CtifQ6PEE2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CtifQ6PEE2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CtifQ6PEE2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CtifQ6PEE2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CtifQ6PEE2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CtifQ6PEE2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CtifQ6PEE2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CtifQ6PEE2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CtifQ6PEE2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CtifQ6PEE2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CtifQ6PEE2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CtifQ6PEE2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CtifQ6PEE2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CtifQ6PEE2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CtifQ6PEE2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CtifQ6PEE2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CtifQ6PEE2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CtifQ6PEE2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CtifQ6PEE2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CtifQ6PEE2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CtifQ6PEE2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CtifQ6PEE2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CtifQ6PEE2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtifQ6PEE2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtifQ6PEE2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtifQ6PEE2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtifQ6PEE2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtifQ6PEE2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CtifQ6PEE2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CtifQ6PEE2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CtifQ6PEE2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CtifQ6PEE2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CtifQ6PEE2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
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