Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sarm1Q6PDS3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sarm1Q6PDS3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sarm1Q6PDS3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sarm1Q6PDS3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sarm1Q6PDS3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sarm1Q6PDS3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sarm1Q6PDS3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sarm1Q6PDS3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sarm1Q6PDS3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sarm1Q6PDS3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sarm1Q6PDS3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sarm1Q6PDS3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sarm1Q6PDS3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sarm1Q6PDS3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sarm1Q6PDS3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sarm1Q6PDS3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sarm1Q6PDS3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sarm1Q6PDS3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sarm1Q6PDS3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sarm1Q6PDS3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sarm1Q6PDS3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sarm1Q6PDS3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sarm1Q6PDS3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sarm1Q6PDS3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sarm1Q6PDS3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sarm1Q6PDS3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sarm1Q6PDS3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sarm1Q6PDS3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sarm1Q6PDS3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sarm1Q6PDS3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sarm1Q6PDS3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sarm1Q6PDS3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sarm1Q6PDS3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sarm1Q6PDS3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sarm1Q6PDS3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sarm1Q6PDS3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sarm1Q6PDS3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sarm1Q6PDS3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sarm1Q6PDS3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sarm1Q6PDS3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sarm1Q6PDS3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sarm1Q6PDS3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sarm1Q6PDS3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.2 ms