Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zbtb39Q6PDK0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zbtb39Q6PDK0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zbtb39Q6PDK0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zbtb39Q6PDK0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zbtb39Q6PDK0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zbtb39Q6PDK0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zbtb39Q6PDK0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zbtb39Q6PDK0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zbtb39Q6PDK0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zbtb39Q6PDK0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Zbtb39Q6PDK0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zbtb39Q6PDK0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zbtb39Q6PDK0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zbtb39Q6PDK0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zbtb39Q6PDK0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Zbtb39Q6PDK0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zbtb39Q6PDK0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zbtb39Q6PDK0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zbtb39Q6PDK0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zbtb39Q6PDK0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zbtb39Q6PDK0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zbtb39Q6PDK0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zbtb39Q6PDK0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zbtb39Q6PDK0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zbtb39Q6PDK0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zbtb39Q6PDK0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zbtb39Q6PDK0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zbtb39Q6PDK0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zbtb39Q6PDK0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zbtb39Q6PDK0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zbtb39Q6PDK0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zbtb39Q6PDK0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zbtb39Q6PDK0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zbtb39Q6PDK0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zbtb39Q6PDK0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zbtb39Q6PDK0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zbtb39Q6PDK0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zbtb39Q6PDK0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zbtb39Q6PDK0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zbtb39Q6PDK0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zbtb39Q6PDK0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zbtb39Q6PDK0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zbtb39Q6PDK0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zbtb39Q6PDK0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zbtb39Q6PDK0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zbtb39Q6PDK0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zbtb39Q6PDK0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zbtb39Q6PDK0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Zbtb39Q6PDK0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zbtb39Q6PDK0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zbtb39Q6PDK0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zbtb39Q6PDK0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zbtb39Q6PDK0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zbtb39Q6PDK0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Zbtb39Q6PDK0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zbtb39Q6PDK0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zbtb39Q6PDK0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zbtb39Q6PDK0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Zbtb39Q6PDK0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zbtb39Q6PDK0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zbtb39Q6PDK0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zbtb39Q6PDK0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zbtb39Q6PDK0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zbtb39Q6PDK0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zbtb39Q6PDK0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zbtb39Q6PDK0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zbtb39Q6PDK0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zbtb39Q6PDK0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zbtb39Q6PDK0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zbtb39Q6PDK0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zbtb39Q6PDK0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zbtb39Q6PDK0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zbtb39Q6PDK0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zbtb39Q6PDK0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zbtb39Q6PDK0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zbtb39Q6PDK0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zbtb39Q6PDK0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zbtb39Q6PDK0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zbtb39Q6PDK0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zbtb39Q6PDK0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zbtb39Q6PDK0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zbtb39Q6PDK0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zbtb39Q6PDK0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zbtb39Q6PDK0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zbtb39Q6PDK0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Zbtb39Q6PDK0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zbtb39Q6PDK0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zbtb39Q6PDK0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zbtb39Q6PDK0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zbtb39Q6PDK0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zbtb39Q6PDK0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zbtb39Q6PDK0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Zbtb39Q6PDK0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zbtb39Q6PDK0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zbtb39Q6PDK0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zbtb39Q6PDK0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zbtb39Q6PDK0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zbtb39Q6PDK0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zbtb39Q6PDK0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms