Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W5

Tsen2, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen2, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsen2Q6P7W5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tsen2Q6P7W5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tsen2Q6P7W5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tsen2Q6P7W5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tsen2Q6P7W5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tsen2Q6P7W5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tsen2Q6P7W5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tsen2Q6P7W5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tsen2Q6P7W5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tsen2Q6P7W5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tsen2Q6P7W5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tsen2Q6P7W5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tsen2Q6P7W5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tsen2Q6P7W5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tsen2Q6P7W5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tsen2Q6P7W5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Tsen2Q6P7W5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tsen2Q6P7W5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Tsen2Q6P7W5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Tsen2Q6P7W5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tsen2Q6P7W5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Tsen2Q6P7W5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tsen2Q6P7W5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Tsen2Q6P7W5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tsen2Q6P7W5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tsen2Q6P7W5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Tsen2Q6P7W5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tsen2Q6P7W5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tsen2Q6P7W5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tsen2Q6P7W5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tsen2Q6P7W5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tsen2Q6P7W5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tsen2Q6P7W5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tsen2Q6P7W5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tsen2Q6P7W5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tsen2Q6P7W5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tsen2Q6P7W5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Tsen2Q6P7W5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Tsen2Q6P7W5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tsen2Q6P7W5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tsen2Q6P7W5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tsen2Q6P7W5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tsen2Q6P7W5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tsen2Q6P7W5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tsen2Q6P7W5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tsen2Q6P7W5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tsen2Q6P7W5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tsen2Q6P7W5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tsen2Q6P7W5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tsen2Q6P7W5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tsen2Q6P7W5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tsen2Q6P7W5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Tsen2Q6P7W5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tsen2Q6P7W5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tsen2Q6P7W5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tsen2Q6P7W5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tsen2Q6P7W5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tsen2Q6P7W5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tsen2Q6P7W5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tsen2Q6P7W5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tsen2Q6P7W5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tsen2Q6P7W5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tsen2Q6P7W5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tsen2Q6P7W5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tsen2Q6P7W5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tsen2Q6P7W5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tsen2Q6P7W5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tsen2Q6P7W5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tsen2Q6P7W5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tsen2Q6P7W5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Tsen2Q6P7W5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tsen2Q6P7W5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tsen2Q6P7W5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Tsen2Q6P7W5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tsen2Q6P7W5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tsen2Q6P7W5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tsen2Q6P7W5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tsen2Q6P7W5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tsen2Q6P7W5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tsen2Q6P7W5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tsen2Q6P7W5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tsen2Q6P7W5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tsen2Q6P7W5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tsen2Q6P7W5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tsen2Q6P7W5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tsen2Q6P7W5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tsen2Q6P7W5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tsen2Q6P7W5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tsen2Q6P7W5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tsen2Q6P7W5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tsen2Q6P7W5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tsen2Q6P7W5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tsen2Q6P7W5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tsen2Q6P7W5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tsen2Q6P7W5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Tsen2Q6P7W5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tsen2Q6P7W5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tsen2Q6P7W5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tsen2Q6P7W5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tsen2Q6P7W5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.1 ms