Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H2

Nes, Nestin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NesQ6P5H2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NesQ6P5H2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NesQ6P5H2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NesQ6P5H2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NesQ6P5H2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NesQ6P5H2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NesQ6P5H2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NesQ6P5H2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NesQ6P5H2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NesQ6P5H2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NesQ6P5H2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NesQ6P5H2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NesQ6P5H2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NesQ6P5H2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NesQ6P5H2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NesQ6P5H2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NesQ6P5H2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NesQ6P5H2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NesQ6P5H2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NesQ6P5H2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NesQ6P5H2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NesQ6P5H2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NesQ6P5H2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NesQ6P5H2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NesQ6P5H2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NesQ6P5H2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NesQ6P5H2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NesQ6P5H2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NesQ6P5H2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NesQ6P5H2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NesQ6P5H2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NesQ6P5H2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NesQ6P5H2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NesQ6P5H2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NesQ6P5H2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NesQ6P5H2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NesQ6P5H2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NesQ6P5H2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NesQ6P5H2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NesQ6P5H2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NesQ6P5H2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NesQ6P5H2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NesQ6P5H2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NesQ6P5H2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NesQ6P5H2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NesQ6P5H2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NesQ6P5H2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NesQ6P5H2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NesQ6P5H2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NesQ6P5H2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NesQ6P5H2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NesQ6P5H2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NesQ6P5H2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NesQ6P5H2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NesQ6P5H2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NesQ6P5H2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NesQ6P5H2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NesQ6P5H2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NesQ6P5H2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NesQ6P5H2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms