Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4S6

Sik3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik3Q6P4S6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sik3Q6P4S6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sik3Q6P4S6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sik3Q6P4S6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sik3Q6P4S6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sik3Q6P4S6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sik3Q6P4S6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Sik3Q6P4S6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sik3Q6P4S6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sik3Q6P4S6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sik3Q6P4S6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sik3Q6P4S6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sik3Q6P4S6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sik3Q6P4S6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sik3Q6P4S6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Sik3Q6P4S6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sik3Q6P4S6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sik3Q6P4S6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sik3Q6P4S6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sik3Q6P4S6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sik3Q6P4S6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sik3Q6P4S6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sik3Q6P4S6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sik3Q6P4S6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sik3Q6P4S6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sik3Q6P4S6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sik3Q6P4S6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sik3Q6P4S6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sik3Q6P4S6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sik3Q6P4S6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sik3Q6P4S6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Sik3Q6P4S6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sik3Q6P4S6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sik3Q6P4S6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sik3Q6P4S6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sik3Q6P4S6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sik3Q6P4S6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sik3Q6P4S6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sik3Q6P4S6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sik3Q6P4S6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sik3Q6P4S6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sik3Q6P4S6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sik3Q6P4S6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sik3Q6P4S6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sik3Q6P4S6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sik3Q6P4S6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sik3Q6P4S6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sik3Q6P4S6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sik3Q6P4S6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sik3Q6P4S6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sik3Q6P4S6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sik3Q6P4S6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sik3Q6P4S6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sik3Q6P4S6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sik3Q6P4S6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sik3Q6P4S6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sik3Q6P4S6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sik3Q6P4S6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sik3Q6P4S6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sik3Q6P4S6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sik3Q6P4S6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sik3Q6P4S6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sik3Q6P4S6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sik3Q6P4S6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sik3Q6P4S6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sik3Q6P4S6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sik3Q6P4S6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sik3Q6P4S6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sik3Q6P4S6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sik3Q6P4S6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sik3Q6P4S6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Sik3Q6P4S6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sik3Q6P4S6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sik3Q6P4S6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sik3Q6P4S6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sik3Q6P4S6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sik3Q6P4S6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sik3Q6P4S6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sik3Q6P4S6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sik3Q6P4S6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sik3Q6P4S6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sik3Q6P4S6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sik3Q6P4S6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sik3Q6P4S6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sik3Q6P4S6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sik3Q6P4S6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sik3Q6P4S6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Sik3Q6P4S6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sik3Q6P4S6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sik3Q6P4S6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sik3Q6P4S6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sik3Q6P4S6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sik3Q6P4S6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Sik3Q6P4S6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sik3Q6P4S6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sik3Q6P4S6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sik3Q6P4S6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sik3Q6P4S6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sik3Q6P4S6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sik3Q6P4S6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms