Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Krt40Q6IFX3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Krt40Q6IFX3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Krt40Q6IFX3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Krt40Q6IFX3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Krt40Q6IFX3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Krt40Q6IFX3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Krt40Q6IFX3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Krt40Q6IFX3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Krt40Q6IFX3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Krt40Q6IFX3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Krt40Q6IFX3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Krt40Q6IFX3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Krt40Q6IFX3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Krt40Q6IFX3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Krt40Q6IFX3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Krt40Q6IFX3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Krt40Q6IFX3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Krt40Q6IFX3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Krt40Q6IFX3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Krt40Q6IFX3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Krt40Q6IFX3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Krt40Q6IFX3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Krt40Q6IFX3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Krt40Q6IFX3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Krt40Q6IFX3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Krt40Q6IFX3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Krt40Q6IFX3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Krt40Q6IFX3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Krt40Q6IFX3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Krt40Q6IFX3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Krt40Q6IFX3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Krt40Q6IFX3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Krt40Q6IFX3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Krt40Q6IFX3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Krt40Q6IFX3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Krt40Q6IFX3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Krt40Q6IFX3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Krt40Q6IFX3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Krt40Q6IFX3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Krt40Q6IFX3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krt40Q6IFX3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krt40Q6IFX3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krt40Q6IFX3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Krt40Q6IFX3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Krt40Q6IFX3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Krt40Q6IFX3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Krt40Q6IFX3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt40Q6IFX3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt40Q6IFX3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt40Q6IFX3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt40Q6IFX3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt40Q6IFX3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt40Q6IFX3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt40Q6IFX3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt40Q6IFX3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt40Q6IFX3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt40Q6IFX3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt40Q6IFX3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt40Q6IFX3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt40Q6IFX3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt40Q6IFX3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt40Q6IFX3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Krt40Q6IFX3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Krt40Q6IFX3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Krt40Q6IFX3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Krt40Q6IFX3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Krt40Q6IFX3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt40Q6IFX3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt40Q6IFX3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt40Q6IFX3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt40Q6IFX3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt40Q6IFX3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt40Q6IFX3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt40Q6IFX3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Krt40Q6IFX3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Krt40Q6IFX3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Krt40Q6IFX3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Krt40Q6IFX3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Krt40Q6IFX3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Krt40Q6IFX3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt40Q6IFX3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt40Q6IFX3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt40Q6IFX3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt40Q6IFX3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Krt40Q6IFX3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt40Q6IFX3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt40Q6IFX3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt40Q6IFX3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt40Q6IFX3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt40Q6IFX3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt40Q6IFX3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt40Q6IFX3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt40Q6IFX3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt40Q6IFX3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt40Q6IFX3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt40Q6IFX3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt40Q6IFX3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt40Q6IFX3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt40Q6IFX3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms